Protein–RNA interactions for Protein: A4FU01

MTMR11, Myotubularin-related protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR11A4FU01 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MTMR11A4FU01 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MTMR11A4FU01 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MTMR11A4FU01 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MTMR11A4FU01 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MTMR11A4FU01 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MTMR11A4FU01 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MTMR11A4FU01 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MTMR11A4FU01 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
MTMR11A4FU01 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MTMR11A4FU01 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MTMR11A4FU01 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MTMR11A4FU01 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MTMR11A4FU01 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MTMR11A4FU01 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MTMR11A4FU01 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MTMR11A4FU01 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MTMR11A4FU01 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MTMR11A4FU01 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MTMR11A4FU01 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MTMR11A4FU01 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
MTMR11A4FU01 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MTMR11A4FU01 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MTMR11A4FU01 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MTMR11A4FU01 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MTMR11A4FU01 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MTMR11A4FU01 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MTMR11A4FU01 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MTMR11A4FU01 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MTMR11A4FU01 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MTMR11A4FU01 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MTMR11A4FU01 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
MTMR11A4FU01 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MTMR11A4FU01 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MTMR11A4FU01 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MTMR11A4FU01 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
MTMR11A4FU01 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MTMR11A4FU01 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MTMR11A4FU01 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MTMR11A4FU01 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MTMR11A4FU01 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MTMR11A4FU01 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MTMR11A4FU01 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MTMR11A4FU01 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MTMR11A4FU01 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MTMR11A4FU01 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MTMR11A4FU01 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MTMR11A4FU01 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MTMR11A4FU01 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MTMR11A4FU01 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MTMR11A4FU01 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
MTMR11A4FU01 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MTMR11A4FU01 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MTMR11A4FU01 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MTMR11A4FU01 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MTMR11A4FU01 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MTMR11A4FU01 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MTMR11A4FU01 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MTMR11A4FU01 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MTMR11A4FU01 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MTMR11A4FU01 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MTMR11A4FU01 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MTMR11A4FU01 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MTMR11A4FU01 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MTMR11A4FU01 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MTMR11A4FU01 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MTMR11A4FU01 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MTMR11A4FU01 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MTMR11A4FU01 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MTMR11A4FU01 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MTMR11A4FU01 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MTMR11A4FU01 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MTMR11A4FU01 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MTMR11A4FU01 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MTMR11A4FU01 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MTMR11A4FU01 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MTMR11A4FU01 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MTMR11A4FU01 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MTMR11A4FU01 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MTMR11A4FU01 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MTMR11A4FU01 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MTMR11A4FU01 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MTMR11A4FU01 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MTMR11A4FU01 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MTMR11A4FU01 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
MTMR11A4FU01 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
MTMR11A4FU01 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
MTMR11A4FU01 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.3
MTMR11A4FU01 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
MTMR11A4FU01 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MTMR11A4FU01 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MTMR11A4FU01 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MTMR11A4FU01 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
MTMR11A4FU01 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
MTMR11A4FU01 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MTMR11A4FU01 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MTMR11A4FU01 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MTMR11A4FU01 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MTMR11A4FU01 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MTMR11A4FU01 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms