Protein–RNA interactions for Protein: A4D1F6

LRRD1, Leucine-rich repeat and death domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 860 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRD1A4D1F6 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRD1A4D1F6 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRD1A4D1F6 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRD1A4D1F6 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRD1A4D1F6 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRD1A4D1F6 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRD1A4D1F6 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRD1A4D1F6 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRD1A4D1F6 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
LRRD1A4D1F6 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
LRRD1A4D1F6 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRD1A4D1F6 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRD1A4D1F6 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRD1A4D1F6 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRD1A4D1F6 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRD1A4D1F6 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRD1A4D1F6 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRD1A4D1F6 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRD1A4D1F6 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRD1A4D1F6 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRD1A4D1F6 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRD1A4D1F6 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRD1A4D1F6 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRD1A4D1F6 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRD1A4D1F6 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRD1A4D1F6 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRD1A4D1F6 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRD1A4D1F6 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRD1A4D1F6 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRD1A4D1F6 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRD1A4D1F6 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRD1A4D1F6 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRD1A4D1F6 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRD1A4D1F6 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRD1A4D1F6 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRD1A4D1F6 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRD1A4D1F6 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRD1A4D1F6 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRD1A4D1F6 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRD1A4D1F6 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRD1A4D1F6 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRD1A4D1F6 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRD1A4D1F6 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRD1A4D1F6 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRD1A4D1F6 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRD1A4D1F6 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRD1A4D1F6 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRD1A4D1F6 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRD1A4D1F6 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRD1A4D1F6 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRD1A4D1F6 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRD1A4D1F6 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRD1A4D1F6 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRD1A4D1F6 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRD1A4D1F6 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRD1A4D1F6 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRD1A4D1F6 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRD1A4D1F6 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRD1A4D1F6 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRD1A4D1F6 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRD1A4D1F6 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRD1A4D1F6 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRD1A4D1F6 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRD1A4D1F6 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRD1A4D1F6 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRD1A4D1F6 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRD1A4D1F6 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRD1A4D1F6 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRD1A4D1F6 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRD1A4D1F6 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRD1A4D1F6 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRD1A4D1F6 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRD1A4D1F6 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRD1A4D1F6 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRD1A4D1F6 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRD1A4D1F6 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRD1A4D1F6 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRD1A4D1F6 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRD1A4D1F6 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRD1A4D1F6 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRD1A4D1F6 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRD1A4D1F6 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRD1A4D1F6 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRD1A4D1F6 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRD1A4D1F6 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRD1A4D1F6 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LRRD1A4D1F6 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
LRRD1A4D1F6 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRRD1A4D1F6 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
LRRD1A4D1F6 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRRD1A4D1F6 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRRD1A4D1F6 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRRD1A4D1F6 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRRD1A4D1F6 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRRD1A4D1F6 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRRD1A4D1F6 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRRD1A4D1F6 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRD1A4D1F6 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRD1A4D1F6 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRD1A4D1F6 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms