Protein–RNA interactions for Protein: A0PK05

TMEM72, Transmembrane protein 72, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM72A0PK05 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TMEM72A0PK05 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TMEM72A0PK05 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TMEM72A0PK05 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TMEM72A0PK05 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TMEM72A0PK05 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TMEM72A0PK05 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TMEM72A0PK05 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TMEM72A0PK05 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TMEM72A0PK05 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TMEM72A0PK05 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
TMEM72A0PK05 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TMEM72A0PK05 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TMEM72A0PK05 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
TMEM72A0PK05 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TMEM72A0PK05 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TMEM72A0PK05 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TMEM72A0PK05 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TMEM72A0PK05 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMEM72A0PK05 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMEM72A0PK05 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMEM72A0PK05 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMEM72A0PK05 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMEM72A0PK05 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMEM72A0PK05 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMEM72A0PK05 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMEM72A0PK05 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
TMEM72A0PK05 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMEM72A0PK05 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMEM72A0PK05 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMEM72A0PK05 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMEM72A0PK05 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMEM72A0PK05 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMEM72A0PK05 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMEM72A0PK05 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMEM72A0PK05 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
TMEM72A0PK05 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMEM72A0PK05 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMEM72A0PK05 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMEM72A0PK05 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
TMEM72A0PK05 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMEM72A0PK05 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMEM72A0PK05 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMEM72A0PK05 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TMEM72A0PK05 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TMEM72A0PK05 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TMEM72A0PK05 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TMEM72A0PK05 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TMEM72A0PK05 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TMEM72A0PK05 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TMEM72A0PK05 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TMEM72A0PK05 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TMEM72A0PK05 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TMEM72A0PK05 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TMEM72A0PK05 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMEM72A0PK05 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMEM72A0PK05 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMEM72A0PK05 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMEM72A0PK05 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMEM72A0PK05 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMEM72A0PK05 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMEM72A0PK05 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMEM72A0PK05 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMEM72A0PK05 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMEM72A0PK05 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
TMEM72A0PK05 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMEM72A0PK05 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMEM72A0PK05 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMEM72A0PK05 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
TMEM72A0PK05 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMEM72A0PK05 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
TMEM72A0PK05 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMEM72A0PK05 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMEM72A0PK05 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
TMEM72A0PK05 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMEM72A0PK05 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMEM72A0PK05 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMEM72A0PK05 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMEM72A0PK05 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMEM72A0PK05 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TMEM72A0PK05 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TMEM72A0PK05 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TMEM72A0PK05 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TMEM72A0PK05 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TMEM72A0PK05 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TMEM72A0PK05 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TMEM72A0PK05 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TMEM72A0PK05 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TMEM72A0PK05 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TMEM72A0PK05 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TMEM72A0PK05 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
TMEM72A0PK05 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMEM72A0PK05 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
TMEM72A0PK05 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMEM72A0PK05 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMEM72A0PK05 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMEM72A0PK05 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMEM72A0PK05 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMEM72A0PK05 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
TMEM72A0PK05 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 125 ms