Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B6F4

TRBV21OR9-2, T-cell receptor beta variable 21/OR9-2 (pseudogene) (Fragment), humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
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