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| PTPRJ | Q12913 | CD33-201 | ENST00000262262 | 1444 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 14 | □□□□□ -0.17 | | |
| PTPRJ | Q12913 | BCCIP-203 | ENST00000368759 | 1433 nt | TSL 1 (best) BASIC | 14 | □□□□□ -0.17 | | |
| PTPRJ | Q12913 | WDR92-201 | ENST00000295121 | 2626 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 14 | □□□□□ -0.17 | | |
| PTPRJ | Q12913 | SPIN3-204 | ENST00000638257 | 4835 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 14 | □□□□□ -0.17 | | |
| PTPRJ | Q12913 | SPECC1L-ADORA2A-201 | ENST00000358654 | 6204 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 14 | □□□□□ -0.17 | | |
| PTPRJ | Q12913 | AXIN2-209 | ENST00000618960 | 4060 nt | TSL 5 BASIC | 14 | □□□□□ -0.17 | | |
| PTPRJ | Q12913 | DYNC1I1-205 | ENST00000447467 | 2947 nt | APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC | 14 | □□□□□ -0.17 | | |
| PTPRJ | Q12913 | FAM122B-203 | ENST00000370790 | 4246 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 14 | □□□□□ -0.17 | | |
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| PTPRJ | Q12913 | PIK3R6-204 | ENST00000619866 | 3041 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 13.98 | □□□□□ -0.17 | | |
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| PTPRJ | Q12913 | ATAT1-204 | ENST00000330083 | 1728 nt | TSL 1 (best) BASIC | 13.98 | □□□□□ -0.17 | | |
| PTPRJ | Q12913 | CDH3-201 | ENST00000264012 | 4929 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 13.98 | □□□□□ -0.17 | | |
| PTPRJ | Q12913 | LATS1-207 | ENST00000543571 | 7517 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 13.97 | □□□□□ -0.17 | | |
| PTPRJ | Q12913 | ZNF793-205 | ENST00000587143 | 1488 nt | APPRIS P1 TSL 4 BASIC | 13.97 | □□□□□ -0.17 | | |
| PTPRJ | Q12913 | ZNF800-203 | ENST00000393313 | 4358 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 13.97 | □□□□□ -0.17 | | |
| PTPRJ | Q12913 | IL12A-AS1-203 | ENST00000497452 | 2425 nt | TSL 2 BASIC | 13.97 | □□□□□ -0.17 | | |
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