Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 60 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 Z97653.2-201ENST00000623057 1418 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 DDR1-232ENST00000418800 3588 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 LINC01254-201ENST00000566225 2908 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 CCDC51-206ENST00000447018 1461 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 GTF2IP20-203ENST00000634905 2966 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 COQ5-201ENST00000288532 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 DERL3-203ENST00000404056 3113 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 BTF3L4-201ENST00000313334 4703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 AC093583.1-201ENST00000462083 2383 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 IL18BP-202ENST00000337131 1606 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 AL391097.1-201ENST00000432706 1620 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 NAT10-202ENST00000527971 1600 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 ETFDH-206ENST00000511912 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 THBS1-201ENST00000260356 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 CNGB1-204ENST00000564448 4364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 SYNPO-204ENST00000519664 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 SERPINI1-202ENST00000446050 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 HSPA8P7-201ENST00000443628 1948 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 USP53-201ENST00000274030 5936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 CEP63-204ENST00000383229 2028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 MAGED2-207ENST00000396224 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 TPCN1-204ENST00000541517 5173 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 UBA3-202ENST00000361055 2154 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 RASSF8-203ENST00000405154 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 TFIP11-204ENST00000407690 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 TTC17-202ENST00000299240 3648 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 CFL1P6-201ENST00000400899 494 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 ELFN1-AS1-201ENST00000415399 636 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 LINC00173-201ENST00000470091 435 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 COQ10BP2-201ENST00000513804 724 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 AC090617.4-201ENST00000572404 422 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC10.72□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 AC008758.4-201ENST00000435033 2593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 AC090502.4-201ENST00000551714 1386 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 SLC7A8-214ENST00000621729 1371 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 TREH-201ENST00000264029 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 MADD-210ENST00000407859 5744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 IL21R-202ENST00000395754 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 ATG5-208ENST00000635758 3035 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 ZCCHC17-201ENST00000344147 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 CCT7P1-201ENST00000406551 1611 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 ALDOA-204ENST00000412304 1603 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 DTX2P1-201ENST00000425797 1633 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 AP000897.1-201ENST00000584036 1613 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 NEXMIF-201ENST00000055682 11719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 RAB27A-201ENST00000336787 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 HNRNPUL1-202ENST00000352456 3426 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 ZSCAN21-205ENST00000543588 1870 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 CPA5-206ENST00000474905 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 ULK4-201ENST00000301831 4613 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 AC091178.1-201ENST00000583447 2305 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 COL11A1-202ENST00000358392 7327 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 LYPD5-201ENST00000377950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 UTP14A-201ENST00000394422 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 TOMM40L-202ENST00000367988 2708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 PTGIS-201ENST00000244043 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 BEND3-201ENST00000369042 6200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 ZNF185-210ENST00000454925 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 AACS-201ENST00000316519 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 MTHFR-203ENST00000376585 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 ANGEL1-201ENST00000251089 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 DDX25-201ENST00000263576 7555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 MRPL27-201ENST00000225969 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 CMTM1-201ENST00000328020 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 CMTM1-202ENST00000332695 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 TPM4-202ENST00000344824 1417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 LDB3-203ENST00000372056 1868 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 CMTM1-205ENST00000379500 1064 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 MRPL36-201ENST00000382647 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 KIR2DL4-205ENST00000396284 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 FAM86FP-202ENST00000427893 829 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 LINC01744-201ENST00000457698 2042 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms