Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH3

NICN1, Nicolin-1, humanhuman

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NICN1Q9BSH3 EME1-201ENST00000338165 2339 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 PBX1-203ENST00000420696 6636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 CYP4F11-205ENST00000620614 2908 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 GREB1-201ENST00000234142 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 MRO-203ENST00000428869 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 CCDC138-201ENST00000295124 2383 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 CSF3R-201ENST00000331941 2375 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 RBM15-205ENST00000618772 3431 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 ZNF621-201ENST00000310898 2404 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 CRBN-215ENST00000639284 2223 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 AREL1-201ENST00000356357 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 Z82195.2-202ENST00000458525 1646 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 AC012358.2-201ENST00000430010 1434 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 SLC25A25-205ENST00000432073 3678 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 AC008132.1-203ENST00000412938 5920 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 SLC8B1-213ENST00000552014 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 LINC01134-203ENST00000442673 3059 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 NDEL1-203ENST00000402554 1858 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 GADL1-201ENST00000282538 3759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 ANGEL2-208ENST00000535388 2517 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 FLNA-202ENST00000360319 8281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 CALR3-201ENST00000269881 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 EPPIN-201ENST00000336443 1217 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 G0S2-201ENST00000367029 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 SSR4-202ENST00000370085 526 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 NME1-NME2-201ENST00000376392 894 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 PCLAF-202ENST00000380258 911 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 DTX3L-202ENST00000383661 687 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 SLC12A9-AS1-201ENST00000412754 369 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 AC073210.1-201ENST00000414799 232 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 TRHDE-AS1-202ENST00000435350 2966 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 GULOP-201ENST00000454030 748 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 BATF-202ENST00000555504 361 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 LINC00677-201ENST00000558224 486 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC11.28□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC11.28□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.28□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC11.28□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 ZNF221-205ENST00000622072 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 AC134407.3-201ENST00000624035 2139 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 AL356966.1-201ENST00000454752 2367 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 CPPED1-202ENST00000381774 6273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 CEP170-203ENST00000366543 6727 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 SCNN1D-202ENST00000338555 3475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 SEMA6D-206ENST00000389428 5874 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 ART3-201ENST00000341029 1517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 AP1G1-218ENST00000569748 4554 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 FILIP1L-203ENST00000383694 3280 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 ASAH2B-202ENST00000374007 3715 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 PLCXD1-203ENST00000399012 5287 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 DQX1-202ENST00000404568 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 CADM1-206ENST00000537058 3550 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 RPL23A-204ENST00000422514 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 AC135050.1-201ENST00000622229 3380 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 YY2-201ENST00000429584 2741 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 C14orf159-219ENST00000521077 2719 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 LINC01987-201ENST00000593118 2281 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 ACADL-201ENST00000233710 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 AC008158.1-201ENST00000578759 3668 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 AJ239328.1-201ENST00000626237 4807 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 NFE2L1-222ENST00000585291 4390 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 STRA6-204ENST00000423167 2776 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 ZNF502-203ENST00000436624 2314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 TUFT1-202ENST00000368848 3033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 SLC1A5-202ENST00000434726 1872 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 AC098650.1-201ENST00000635992 3535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 KIAA0391-211ENST00000605870 1406 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 DIAPH2-201ENST00000324765 9333 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 CXorf40B-203ENST00000370406 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 NPC1L1-204ENST00000546276 4826 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 RORC-201ENST00000318247 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 KLC4-201ENST00000259708 2688 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 GPATCH2L-212ENST00000557263 1458 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 GTF2F2-201ENST00000340473 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 DFFB-205ENST00000378209 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 SPDYE8P-201ENST00000333385 2281 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 SPDYE11-201ENST00000340073 2281 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 SPDYE9P-203ENST00000575125 2281 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 AC018904.2-201ENST00000561202 1757 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 ECI2-207ENST00000465828 1548 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
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