Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 MCC-201ENST00000302475 8257 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 EEF2KMT-202ENST00000458008 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 PATJ-215ENST00000635137 2298 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 SLC7A9-201ENST00000023064 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 PDLIM5-210ENST00000508216 1794 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 C22orf23-206ENST00000619227 1777 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 FLT4-206ENST00000502649 4140 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 ARMT1-204ENST00000545879 2495 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 TRIM37-201ENST00000262294 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 NOP2-201ENST00000322166 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 STARD13-202ENST00000336934 5917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC11.93□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 EHF-208ENST00000530286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 AC055717.2-201ENST00000561864 577 ntTSL 4 BASIC11.93□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC11.93□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC11.93□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 SPATA33-201ENST00000301031 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 FCHO1-234ENST00000600676 3094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 PPFIA2-227ENST00000552948 3976 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 DLGAP4-213ENST00000489701 2396 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 RAPGEF3-201ENST00000389212 3294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 CIZ1-228ENST00000634901 3462 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 FMO6P-202ENST00000367754 2130 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 CADM3-AS1-201ENST00000415675 5044 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 FLNA-201ENST00000344736 7932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 CEP126-201ENST00000263468 7039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 PDE6B-212ENST00000496514 3232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 RPL13AP17-204ENST00000450028 1895 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 IKBKB-230ENST00000629753 4069 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 FMO3-201ENST00000367755 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 LIMK1-202ENST00000418310 3360 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 SLC1A7-205ENST00000620288 3378 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 PPP1R17-201ENST00000342032 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 RPS6KA2-203ENST00000405189 2282 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 TIAM1-201ENST00000286827 7200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 CERS2-214ENST00000561294 1803 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 SLC4A11-201ENST00000380056 3094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 PPP1R12B-201ENST00000290419 2227 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 MIER2-201ENST00000264819 6884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 LHX6-202ENST00000373754 3278 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 KY-205ENST00000508956 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 MICAL3-203ENST00000400561 3046 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 ZNF142-205ENST00000449707 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 AC011899.1-201ENST00000436489 3600 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 LRP1-207ENST00000554174 2175 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 TRPC7-206ENST00000513104 2987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 PDHB-201ENST00000302746 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 AC055813.1-201ENST00000587110 2123 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 HDAC8-214ENST00000439122 2338 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 ADD1-207ENST00000446856 3745 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 ANKRD13A-201ENST00000261739 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 DGCR5-203ENST00000438934 5492 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 SMOC1-202ENST00000381280 3666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 ELMOD3-201ENST00000315658 2685 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 URM1-203ENST00000372853 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 AC099489.3-201ENST00000572950 2279 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 AC092135.1-201ENST00000623398 2059 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 GOLGA8T-202ENST00000569052 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 LINC02267-201ENST00000513393 1687 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 UBTFL5-201ENST00000443682 1191 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 AP003170.2-201ENST00000544730 786 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 CEP95-212ENST00000581056 903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
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