Protein–RNA interactions for Protein: P28676

GCA, Grancalcin, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCAP28676 ABL2-202ENST00000367623 3486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
GCAP28676 NF2-207ENST00000397789 1857 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
GCAP28676 KLHL23-202ENST00000392647 4077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
GCAP28676 LILRP2-202ENST00000413572 1383 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
GCAP28676 MKRN7P-201ENST00000433469 1371 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
GCAP28676 AC112176.1-201ENST00000565428 3024 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
GCAP28676 FAM170A-206ENST00000613773 1374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
GCAP28676 DPYSL2-204ENST00000521913 4805 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
GCAP28676 NOSTRIN-203ENST00000397209 1437 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
GCAP28676 TP53I11-220ENST00000533940 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
GCAP28676 YLPM1-207ENST00000552421 4899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
GCAP28676 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
GCAP28676 PRPF40B-202ENST00000380281 3154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
GCAP28676 CEP63-204ENST00000383229 2028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
GCAP28676 ERBB2-203ENST00000445658 3238 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
GCAP28676 KRT8P25-201ENST00000473150 1456 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
GCAP28676 CPVL-201ENST00000265394 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
GCAP28676 GRAMD1B-215ENST00000638086 2665 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
GCAP28676 AGA-201ENST00000264595 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
GCAP28676 EEF1AKMT3-202ENST00000333012 2762 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
GCAP28676 PSMC5-201ENST00000310144 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
GCAP28676 PTPN6-201ENST00000318974 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
GCAP28676 DYNC1I1-204ENST00000437599 2895 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
GCAP28676 CEP89-207ENST00000591863 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
GCAP28676 FCHO1-208ENST00000595033 2907 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
GCAP28676 CPLX2-201ENST00000359546 5023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
GCAP28676 ADAMTSL2-202ENST00000393060 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
GCAP28676 AKNA-201ENST00000223791 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
GCAP28676 BCDIN3D-AS1-201ENST00000548872 3078 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
GCAP28676 OR2V2-202ENST00000641492 4777 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.32
GCAP28676 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
GCAP28676 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
GCAP28676 MARCH3-201ENST00000308660 4196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
GCAP28676 PIM1-201ENST00000373509 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
GCAP28676 MYOM3-202ENST00000374434 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
GCAP28676 AFDN-206ENST00000392112 7459 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
GCAP28676 RHCG-201ENST00000268122 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
GCAP28676 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
GCAP28676 SLC38A7-215ENST00000570101 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
GCAP28676 ZNF684-203ENST00000372699 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
GCAP28676 ZNF485-202ENST00000374435 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
GCAP28676 ARHGAP25-203ENST00000409220 2939 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
GCAP28676 MESD-206ENST00000561312 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
GCAP28676 GLYR1-201ENST00000321919 3772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
GCAP28676 ASAP1-201ENST00000357668 6344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
GCAP28676 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
GCAP28676 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
GCAP28676 HMGCLL1-203ENST00000370850 1171 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
GCAP28676 MBD3L4-201ENST00000381394 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
GCAP28676 CHEK2-203ENST00000382565 696 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
GCAP28676 TOMM5-203ENST00000401811 789 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
GCAP28676 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
GCAP28676 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
GCAP28676 PRR13-202ENST00000429243 1229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
GCAP28676 RBMXP2-201ENST00000434705 1168 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
GCAP28676 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
GCAP28676 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
GCAP28676 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
GCAP28676 RPAIN-205ENST00000536255 1057 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
GCAP28676 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
GCAP28676 AOC3-206ENST00000613571 3900 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
GCAP28676 CASC15-204ENST00000606197 3969 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
GCAP28676 AC116903.2-201ENST00000561674 1304 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
GCAP28676 ZNF202-201ENST00000336139 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
GCAP28676 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
GCAP28676 ACR-201ENST00000216139 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
GCAP28676 UGT1A1-201ENST00000305208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
GCAP28676 BDH1-201ENST00000358186 3330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
GCAP28676 CCNG1-201ENST00000340828 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
GCAP28676 IL17REL-201ENST00000341280 3500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
GCAP28676 TAS1R2-201ENST00000375371 2542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
GCAP28676 PSMA1-201ENST00000396394 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
GCAP28676 RECQL5-204ENST00000423245 3576 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
GCAP28676 HEXIM1-201ENST00000332499 3600 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
GCAP28676 HPGD-214ENST00000542498 2786 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
GCAP28676 XYLB-203ENST00000427323 1666 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
GCAP28676 LINC00511-202ENST00000457958 1696 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
GCAP28676 SYT17-204ENST00000562711 1702 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
GCAP28676 RIC1-203ENST00000414202 6774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
GCAP28676 EDEM3-201ENST00000318130 6898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
GCAP28676 GMEB2-201ENST00000266068 4559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
GCAP28676 CDC25C-202ENST00000348983 1951 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
GCAP28676 UBFD1-207ENST00000567212 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
GCAP28676 LHFPL2-201ENST00000380345 5043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
GCAP28676 IFT74-201ENST00000380062 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
GCAP28676 C10orf71-201ENST00000374144 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
GCAP28676 BCL2L11-221ENST00000621302 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
GCAP28676 BCL2L11-222ENST00000622509 5231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
GCAP28676 SAP18-201ENST00000382533 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
GCAP28676 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
GCAP28676 AGRN-210ENST00000620552 7394 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
GCAP28676 DNMT3A-202ENST00000321117 4279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
GCAP28676 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
GCAP28676 CARS-202ENST00000380525 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
GCAP28676 WFDC5-202ENST00000372789 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
GCAP28676 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
GCAP28676 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
GCAP28676 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
GCAP28676 IGHV3-74-201ENST00000424969 587 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
GCAP28676 AL049597.1-201ENST00000447415 555 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.5 ms