Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 CHEK1-203ENST00000428830 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMPOP42166 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMPOP42166 MIS12-202ENST00000573759 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMPOP42166 OCA2-201ENST00000353809 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMPOP42166 ZBED6CL-201ENST00000343855 2933 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
TMPOP42166 PIAS1-202ENST00000545237 2932 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TMPOP42166 SUCO-209ENST00000610051 2925 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TMPOP42166 ALOX5-208ENST00000612635 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMPOP42166 PHB-215ENST00000617874 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TMPOP42166 ARHGEF9-226ENST00000636392 1920 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TMPOP42166 SEC24B-202ENST00000399100 3780 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMPOP42166 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TMPOP42166 KCNT1-213ENST00000630792 3606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TMPOP42166 AL365259.1-204ENST00000606001 2635 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMPOP42166 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMPOP42166 OR13A1-202ENST00000536058 2023 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMPOP42166 FGF21-202ENST00000593756 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMPOP42166 AC005865.2-203ENST00000636557 2959 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMPOP42166 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMPOP42166 OSER1-AS1-202ENST00000437730 1563 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMPOP42166 NRDC-202ENST00000354831 3895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMPOP42166 MYO1C-218ENST00000575158 4804 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMPOP42166 ALLC-201ENST00000252505 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMPOP42166 DBF4B-202ENST00000393547 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMPOP42166 SEMA3F-201ENST00000002829 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMPOP42166 SLC35A2-203ENST00000376515 1044 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMPOP42166 PARK7-204ENST00000377493 795 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMPOP42166 SOD2-205ENST00000444946 917 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMPOP42166 TREX1-203ENST00000456089 629 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMPOP42166 AP003351.1-201ENST00000522743 668 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMPOP42166 IFI27L1-212ENST00000557218 413 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMPOP42166 Metazoa_SRP.147-201ENST00000576563 312 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TMPOP42166 SNX20-205ENST00000610485 557 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMPOP42166 OR4C3-202ENST00000611380 597 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TMPOP42166 RAB5B-211ENST00000628569 496 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMPOP42166 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMPOP42166 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMPOP42166 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMPOP42166 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMPOP42166 SFPQP1-201ENST00000446621 1786 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TMPOP42166 SLC45A1-201ENST00000289877 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMPOP42166 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMPOP42166 ZCCHC8-207ENST00000543897 5663 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMPOP42166 ABLIM2-206ENST00000447017 2902 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMPOP42166 AC104129.1-202ENST00000480694 4481 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMPOP42166 CYP26B1-201ENST00000001146 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMPOP42166 MAP7-201ENST00000354570 4152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMPOP42166 GOLGA8O-201ENST00000509311 1997 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMPOP42166 NLRP7-207ENST00000590030 3209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMPOP42166 DNASE1L3-207ENST00000486455 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMPOP42166 CRYBG2-201ENST00000308182 5245 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMPOP42166 TBC1D2-204ENST00000375066 3198 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMPOP42166 SLC2A9-208ENST00000506583 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMPOP42166 AMDHD2-202ENST00000302956 3273 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMPOP42166 TPO-202ENST00000345913 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMPOP42166 SIRPA-203ENST00000400068 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMPOP42166 EDEM2-201ENST00000374491 1756 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMPOP42166 BNIP1-203ENST00000352523 1143 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMPOP42166 ARPC5-203ENST00000367534 622 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMPOP42166 KHDC1L-201ENST00000370388 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMPOP42166 TREM2-202ENST00000373113 1044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMPOP42166 C9orf24-202ENST00000379124 648 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMPOP42166 PRAME-206ENST00000406503 740 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMPOP42166 YY1P2-201ENST00000438766 948 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TMPOP42166 CIDEC-205ENST00000443115 443 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMPOP42166 DERL1-204ENST00000519018 575 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMPOP42166 BLOC1S1-202ENST00000548556 525 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMPOP42166 PCTP-206ENST00000573500 919 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMPOP42166 AC011495.2-201ENST00000600665 360 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMPOP42166 MFSD11-217ENST00000590514 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMPOP42166 SUPV3L1-201ENST00000359655 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMPOP42166 SCHIP1-201ENST00000445224 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMPOP42166 CHIAP2-201ENST00000369743 2829 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMPOP42166 FAM189A1-201ENST00000261275 4705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMPOP42166 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMPOP42166 GUCY1B3-204ENST00000505154 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMPOP42166 ATAT1-204ENST00000330083 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMPOP42166 TJAP1-204ENST00000372449 2695 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMPOP42166 ECM1-202ENST00000369047 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMPOP42166 BRPF1-205ENST00000433861 4304 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMPOP42166 KCNH4-202ENST00000607371 3723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMPOP42166 PTK2-202ENST00000395218 4415 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMPOP42166 PLEKHG3-203ENST00000471182 3106 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMPOP42166 ELP4-225ENST00000640533 1801 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMPOP42166 NCS1-201ENST00000372398 4991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMPOP42166 KDELR1-201ENST00000330720 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMPOP42166 PI4KB-201ENST00000368872 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMPOP42166 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMPOP42166 BX005132.1-201ENST00000641403 1580 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TMPOP42166 POLD1-205ENST00000595904 3402 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMPOP42166 PPP1R12B-214ENST00000491336 2046 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMPOP42166 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMPOP42166 CD99L2-205ENST00000437787 3493 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMPOP42166 BAIAP2-202ENST00000321300 2879 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMPOP42166 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TMPOP42166 COL18A1-AS1-201ENST00000397787 3425 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMPOP42166 AL109615.2-201ENST00000455005 1608 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMPOP42166 KIAA1683-201ENST00000392413 4402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMPOP42166 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMPOP42166 CHRDL2-201ENST00000263671 1712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.9 ms