Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 BRI3P1-201ENST00000440440 378 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC11.98□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 MIR3940-201ENST00000579148 102 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 AC005498.2-204ENST00000590613 413 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 PDCD4-202ENST00000393104 3697 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 STAT5A-209ENST00000588868 3629 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 APBB2-214ENST00000508593 3592 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 CIC-204ENST00000572681 8218 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 SLC44A1-202ENST00000374723 9640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 CYP2B6-201ENST00000324071 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 TARS2-204ENST00000369064 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 PMEPA1-203ENST00000347215 4546 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 PMEPA1-205ENST00000395816 4519 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 AAK1-201ENST00000406297 4499 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 BCOR-212ENST00000615339 2618 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 UNC45B-203ENST00000591048 2553 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 NUP133-201ENST00000261396 5207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 DNAI2-206ENST00000582036 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 LINC01391-203ENST00000495287 3538 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 NDUFB4P11-202ENST00000600530 2079 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 WDR6-207ENST00000448293 3377 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 ULK4-201ENST00000301831 4613 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 TACC1-208ENST00000520340 1976 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 CYB5RL-201ENST00000287899 5777 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 KLF17-201ENST00000372299 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 CFAP157-202ENST00000373295 1721 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 LINC00511-202ENST00000457958 1696 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 KIAA0368-202ENST00000338205 7078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 AL109615.2-201ENST00000455005 1608 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 ELOVL1-216ENST00000621943 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 PTPRN2-202ENST00000389416 4692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 OSBPL7-201ENST00000007414 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 AL031733.2-201ENST00000451992 2523 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 PTPRS-202ENST00000353284 4518 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 COL11A1-210ENST00000512756 5442 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 SMIM8-204ENST00000392863 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 FAM86FP-202ENST00000427893 829 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 MUSTN1-202ENST00000486659 622 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 EBF2-203ENST00000520164 5145 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 LRRC15-201ENST00000347624 5883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 CECR3-201ENST00000428828 1915 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 SLC27A6-202ENST00000395266 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 GBA-204ENST00000428024 1817 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 SPIN2A-202ENST00000374908 2468 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 AFF3-201ENST00000317233 8135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 MRPL22-207ENST00000523037 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 AC139099.1-202ENST00000574098 2409 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 SMARCA2-209ENST00000382203 5867 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 ABCB9-204ENST00000392439 3791 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 ABCB9-206ENST00000442028 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 ASPH-205ENST00000445642 3717 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 SOX30-203ENST00000519442 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 TLL2-201ENST00000357947 6756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 PPARA-202ENST00000402126 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 MYOZ3-201ENST00000297130 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 SFI1-203ENST00000400288 4002 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 BDNF-215ENST00000530861 3918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 GIMAP6-203ENST00000618759 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 BTNL8-211ENST00000610640 1488 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 MST1R-215ENST00000621387 4449 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms