Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 CTSH-218ENST00000615999 972 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMPOP42166 NTRK3-204ENST00000360948 3004 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMPOP42166 ABCC4-206ENST00000536256 2840 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMPOP42166 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMPOP42166 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TMPOP42166 ATG5-202ENST00000360666 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TMPOP42166 ITGA6-202ENST00000409080 5306 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TMPOP42166 AGA-201ENST00000264595 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TMPOP42166 CACNA2D2-204ENST00000424201 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TMPOP42166 COPS7A-201ENST00000229251 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMPOP42166 BMP4-205ENST00000558984 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMPOP42166 FAM198B-201ENST00000296530 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMPOP42166 BRSK1-206ENST00000590333 2977 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMPOP42166 COL6A1-201ENST00000361866 4238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMPOP42166 FAM95B1-211ENST00000592053 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMPOP42166 AL669942.1-203ENST00000610972 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMPOP42166 EPB41L2-205ENST00000445890 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMPOP42166 BCO2-202ENST00000361053 1868 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMPOP42166 RHOH-221ENST00000615577 2227 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMPOP42166 RHOH-223ENST00000619474 2230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMPOP42166 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMPOP42166 SLC50A1-203ENST00000368404 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMPOP42166 SEZ6L-201ENST00000248933 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMPOP42166 SEZ6L-210ENST00000629590 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMPOP42166 STRIP2-202ENST00000435494 2866 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMPOP42166 BX088651.4-202ENST00000428895 1479 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMPOP42166 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TMPOP42166 CCDC97-201ENST00000269967 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMPOP42166 SULT1A3-201ENST00000338971 1097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMPOP42166 ATP5S-203ENST00000358473 801 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMPOP42166 PRKRIP1-202ENST00000462601 884 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMPOP42166 DPY19L2P4-201ENST00000479881 442 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TMPOP42166 AC004923.3-201ENST00000527532 355 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TMPOP42166 TRAPPC4-212ENST00000533058 1209 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMPOP42166 AC108471.2-201ENST00000533736 1061 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMPOP42166 INCA1-202ENST00000574617 1260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMPOP42166 INCA1-204ENST00000576820 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMPOP42166 MIR5001-201ENST00000580185 100 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TMPOP42166 AC012615.6-203ENST00000590531 272 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMPOP42166 WDR60-202ENST00000407559 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMPOP42166 GMEB1-201ENST00000294409 1912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMPOP42166 ROPN1B-202ENST00000504401 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMPOP42166 KIR2DL4-204ENST00000359085 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMPOP42166 ZCCHC9-203ENST00000407610 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMPOP42166 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMPOP42166 ALOX15P2-201ENST00000340858 1897 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TMPOP42166 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMPOP42166 NR4A1-201ENST00000243050 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMPOP42166 AC126564.1-201ENST00000623628 2013 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TMPOP42166 KCNJ11-201ENST00000339994 2801 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMPOP42166 LINC02125-201ENST00000512279 2198 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMPOP42166 PKMP1-201ENST00000455804 1523 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TMPOP42166 NLRP7-202ENST00000340844 3250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMPOP42166 ZWILCH-209ENST00000565627 1845 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TMPOP42166 PLPP6-201ENST00000381883 2944 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
TMPOP42166 HMGA2-204ENST00000403681 4473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMPOP42166 ATXN2L-215ENST00000564304 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMPOP42166 POLD1-214ENST00000613923 3542 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TMPOP42166 MIR9-3HG-201ENST00000536780 4778 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
TMPOP42166 DCDC2B-201ENST00000409358 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMPOP42166 SLC6A2-201ENST00000219833 2858 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TMPOP42166 PAX8-204ENST00000397647 3633 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMPOP42166 PIM2-201ENST00000376509 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMPOP42166 LNP1-201ENST00000383693 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMPOP42166 RUFY4-201ENST00000344321 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TMPOP42166 PNPLA5-205ENST00000597664 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMPOP42166 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMPOP42166 AL645937.6-201ENST00000641122 3727 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TMPOP42166 GALC-201ENST00000261304 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMPOP42166 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMPOP42166 CDK7-201ENST00000256443 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMPOP42166 TMEM186-201ENST00000333050 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMPOP42166 NDUFS5-201ENST00000372967 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMPOP42166 NDUFS5-202ENST00000372969 548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMPOP42166 GULP1-207ENST00000409843 2643 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TMPOP42166 AC019349.1-201ENST00000411759 476 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
TMPOP42166 AL078621.2-201ENST00000419351 698 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TMPOP42166 AC000077.1-201ENST00000420012 953 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TMPOP42166 AL359092.2-201ENST00000423330 585 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TMPOP42166 AL157832.2-206ENST00000428178 601 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
TMPOP42166 AC098934.2-202ENST00000438944 1033 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TMPOP42166 AC117945.1-201ENST00000451375 463 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
TMPOP42166 GIMAP4-202ENST00000461940 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TMPOP42166 AC139795.1-201ENST00000499314 838 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TMPOP42166 AC092612.1-201ENST00000514501 998 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TMPOP42166 AC080023.2-201ENST00000532615 208 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TMPOP42166 AP003170.2-201ENST00000544730 786 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TMPOP42166 MT1X-202ENST00000562939 538 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMPOP42166 MSRB1-205ENST00000564908 550 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
TMPOP42166 AC026461.1-201ENST00000567563 551 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
TMPOP42166 SNHG5-211ENST00000587692 1029 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
TMPOP42166 HAMP-203ENST00000598398 652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TMPOP42166 TRMT112P6-201ENST00000599234 372 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TMPOP42166 RAB11B-205ENST00000601897 577 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
TMPOP42166 AC083798.2-202ENST00000609469 553 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
TMPOP42166 AC005746.3-201ENST00000614751 393 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TMPOP42166 DZANK1-201ENST00000262547 3498 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TMPOP42166 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMPOP42166 AGAP5-202ENST00000443782 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMPOP42166 SIGLEC12-201ENST00000291707 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.3 ms