Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH3

NICN1, Nicolin-1, humanhuman

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NICN1Q9BSH3 DNMT1-202ENST00000359526 5206 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 TTC39B-202ENST00000380850 3221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 PXMP4-203ENST00000409299 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 CEACAM20-203ENST00000614924 1809 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 NLRP1-202ENST00000269280 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 ACTN2-201ENST00000366578 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 SEPT9-201ENST00000329047 4453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 EDRF1-201ENST00000337623 4387 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 CERCAM-214ENST00000613052 1429 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 AQP2-201ENST00000199280 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 SUN2-202ENST00000405510 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 PGGHG-203ENST00000409548 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 ERVK13-1-205ENST00000568395 5578 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 KCNN1-201ENST00000222249 3625 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 CDH1-212ENST00000611625 4878 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 PCDHGA6-201ENST00000517434 4775 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 SEC31A-208ENST00000448323 4255 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 PAPLN-208ENST00000555445 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 SHMT2-205ENST00000553474 1765 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 CARHSP1-218ENST00000614449 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 HERC3-203ENST00000407637 2634 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 PLAT-202ENST00000352041 2516 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 FOXD2-AS1-201ENST00000445551 2509 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 ZSCAN5DP-201ENST00000600684 1488 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 PPP6R2-209ENST00000612753 4104 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 PARN-203ENST00000437198 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 OR52M2P-201ENST00000414298 959 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 RPL15-205ENST00000415719 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 AC041040.1-201ENST00000425197 460 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 AL512288.1-201ENST00000448015 491 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 FTH1P22-201ENST00000456305 520 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 AADACL2-AS1-202ENST00000483843 628 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 RN7SL564P-201ENST00000496309 250 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 RN7SKP155-201ENST00000516031 288 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 LINC02376-201ENST00000536330 724 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 AL132994.1-201ENST00000554098 400 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 SMIM22-206ENST00000589327 629 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 FAM90A28P-201ENST00000596881 489 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 MCEMP1-202ENST00000597445 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 MIR8071-1-201ENST00000616769 65 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 MIR8071-2-201ENST00000616772 65 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 MCM3AP-201ENST00000291688 6193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 AC008676.1-201ENST00000508443 1932 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 MUC20-205ENST00000447234 2589 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 MAK16-201ENST00000360128 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 C1orf216-201ENST00000270815 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 AC011511.5-201ENST00000589379 3219 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 GDPD5-202ENST00000443276 3106 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 TMEM74B-201ENST00000381894 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 CTRL-205ENST00000574481 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 AC007614.5-201ENST00000623424 8892 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 IL18BP-202ENST00000337131 1606 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 SQSTM1-201ENST00000360718 2253 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 AC023355.1-202ENST00000612262 4242 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 SLC6A6-204ENST00000613060 6526 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 SLC5A11-201ENST00000347898 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 NEK3-210ENST00000620675 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 KLHL30-201ENST00000409223 3726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 GZF1-201ENST00000338121 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 SCML1-201ENST00000380041 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 PBOV1-201ENST00000527246 2506 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 GAS7-219ENST00000585266 3535 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 ATP6V1B1-201ENST00000234396 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 AP002008.2-201ENST00000635926 4870 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 CHGB-201ENST00000378961 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 SNX14-201ENST00000314673 3486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 LINC01544-201ENST00000567801 5168 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 MYO19-203ENST00000610930 3271 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 NTRK2-208ENST00000395882 7111 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 MANEAL-201ENST00000329006 1930 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 SMCR8-201ENST00000406438 8279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 FAM157C-201ENST00000563357 1806 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 USP14-208ENST00000582707 1803 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 TCAF2-201ENST00000357344 2958 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 ANKZF1-202ENST00000409849 2155 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 IYD-208ENST00000500320 2158 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 CHST4-202ENST00000539698 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 MSANTD2P1-201ENST00000445341 1368 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 TFDP2-215ENST00000489671 9857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 PHLPP2-204ENST00000567016 4812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 PRPF18-202ENST00000378572 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 GRK7-201ENST00000264952 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 LOXHD1-210ENST00000536736 6848 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
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