Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 CLNS1A-204ENST00000525428 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 AMT-256ENST00000638063 1783 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 SLC4A7-203ENST00000425128 7970 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 SFTPA1-203ENST00000428376 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 UNC93A-202ENST00000366829 1810 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 TIRAP-202ENST00000392679 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 PRRC2A-202ENST00000376033 6893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 ZC2HC1C-203ENST00000524913 4283 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 FBF1-212ENST00000636174 3626 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 DNPEP-205ENST00000373972 1578 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 GPR173-201ENST00000332582 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 AP000229.1-201ENST00000608591 1979 ntTSL 4 BASIC12.02□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 SUPT5H-201ENST00000359191 3770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 DDC-206ENST00000431062 1620 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 GOT2-202ENST00000434819 1615 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 SF3B1-204ENST00000414963 651 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 WIPF1-204ENST00000392547 4587 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 GAA-202ENST00000390015 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 RAP1GAP2-203ENST00000540393 3218 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 PPIL2-201ENST00000335025 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 IKZF1-203ENST00000346667 5376 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 ASXL1-201ENST00000306058 6591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 AL139348.1-201ENST00000569070 2208 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 CLTC-202ENST00000393043 5292 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 LILRA1-202ENST00000453777 2313 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 PNPLA6-203ENST00000450331 4457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 UBR4-203ENST00000375225 1533 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 CUL4A-204ENST00000451881 3724 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 MON2-212ENST00000552115 3760 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 LRPAP1-202ENST00000500728 7819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 CHD4-211ENST00000544484 6554 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 IRAK1BP1-201ENST00000369940 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 ZFYVE27-203ENST00000359980 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 FAM81A-201ENST00000288228 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 KCNMB3-203ENST00000392685 1608 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 AL157832.2-205ENST00000597245 1649 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 DRC7-202ENST00000360716 3041 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 MOV10-203ENST00000369645 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 R3HDM2-215ENST00000634871 4092 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 FOXJ3-202ENST00000361776 5106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 RECQL5-201ENST00000317905 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 HSD3B2-206ENST00000543831 1783 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 AC109597.2-201ENST00000569407 927 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 AL591926.3-201ENST00000611630 238 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 AMPD2-201ENST00000256578 3899 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
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