Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 ECM1-203ENST00000369049 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 MYT1L-204ENST00000428368 4850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 AKR1C2-202ENST00000421196 1481 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 ZNF304-204ENST00000598744 3331 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 GMEB2-202ENST00000370069 4011 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 MAGEB1-202ENST00000397548 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 DMKN-203ENST00000402589 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 MAX-218ENST00000557746 571 ntTSL 4 BASIC12.04□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 LINC00052-201ENST00000560153 1966 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 ZNF133-215ENST00000630056 1999 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 AC079465.1-201ENST00000416046 3361 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 USP33-204ENST00000370794 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 PIK3R5-218ENST00000611902 4339 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 SLC44A3-AS1-215ENST00000634870 5956 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 SIRPA-201ENST00000356025 3867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 SERPINE1-201ENST00000223095 3190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 MYO16-205ENST00000457511 7436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 CPPED1-202ENST00000381774 6273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 TRIM40-206ENST00000376724 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 PLEKHH1-201ENST00000329153 6604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 LINC01658-201ENST00000320372 1578 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 BTN2A2-204ENST00000432533 1570 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 VAPB-202ENST00000395802 1834 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 ACACA-237ENST00000616317 9961 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 TIMMDC1-208ENST00000494664 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 SLC5A11-210ENST00000568579 2139 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 LDB3-205ENST00000429277 5436 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 LINC01446-201ENST00000380970 3484 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 AC040160.2-201ENST00000623816 1675 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 SNAPC2-206ENST00000597584 1413 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 PAPSS1-201ENST00000265174 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 GAB1-202ENST00000262995 7981 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 ICOS-202ENST00000435193 2528 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 RCC2P5-201ENST00000492126 1487 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 KCNA4-201ENST00000328224 4172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 ZCWPW1-208ENST00000490721 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 SUPT7L-204ENST00000406540 2869 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 USP14-208ENST00000582707 1803 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 RNF17-202ENST00000255325 2134 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 NME1-NME2-201ENST00000376392 894 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 C20orf141-201ENST00000380589 730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 SKA1-202ENST00000398452 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 Z82188.2-201ENST00000419128 630 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 LINC02369-202ENST00000540745 801 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC12.03□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC12.03□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 ZNF646-202ENST00000394979 8118 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 STRAP-202ENST00000419869 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 SCN8A-209ENST00000627620 5943 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 AL353593.1-201ENST00000602517 3955 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 COL4A6-209ENST00000545689 6380 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 HYDIN-209ENST00000538248 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 KIRREL1-201ENST00000359209 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 AC092611.1-201ENST00000514269 2565 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 PARGP1-201ENST00000417555 2286 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 AC009133.3-201ENST00000565600 1656 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 CAMK2B-209ENST00000395749 4447 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 EHD2-201ENST00000263277 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 STRADA-205ENST00000447001 2014 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
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