Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R9

CCDC61, Coiled-coil domain-containing protein 61, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC61Q9Y6R9 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.53■■■□□ 2.48
CCDC61Q9Y6R9 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
CCDC61Q9Y6R9 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC30.53■■■□□ 2.48
CCDC61Q9Y6R9 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC30.53■■■□□ 2.48
CCDC61Q9Y6R9 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
CCDC61Q9Y6R9 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
CCDC61Q9Y6R9 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
CCDC61Q9Y6R9 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
CCDC61Q9Y6R9 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC30.52■■■□□ 2.48
CCDC61Q9Y6R9 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
CCDC61Q9Y6R9 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
CCDC61Q9Y6R9 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.52■■■□□ 2.48
CCDC61Q9Y6R9 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
CCDC61Q9Y6R9 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.48
CCDC61Q9Y6R9 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
CCDC61Q9Y6R9 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
CCDC61Q9Y6R9 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
CCDC61Q9Y6R9 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
CCDC61Q9Y6R9 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
CCDC61Q9Y6R9 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
CCDC61Q9Y6R9 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
CCDC61Q9Y6R9 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
CCDC61Q9Y6R9 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
CCDC61Q9Y6R9 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
CCDC61Q9Y6R9 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC30.51■■■□□ 2.47
CCDC61Q9Y6R9 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
CCDC61Q9Y6R9 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
CCDC61Q9Y6R9 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
CCDC61Q9Y6R9 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
CCDC61Q9Y6R9 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
CCDC61Q9Y6R9 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
CCDC61Q9Y6R9 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
CCDC61Q9Y6R9 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
CCDC61Q9Y6R9 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
CCDC61Q9Y6R9 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
CCDC61Q9Y6R9 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
CCDC61Q9Y6R9 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
CCDC61Q9Y6R9 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC30.49■■■□□ 2.47
CCDC61Q9Y6R9 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
CCDC61Q9Y6R9 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
CCDC61Q9Y6R9 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
CCDC61Q9Y6R9 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.48■■■□□ 2.47
CCDC61Q9Y6R9 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
CCDC61Q9Y6R9 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
CCDC61Q9Y6R9 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
CCDC61Q9Y6R9 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
CCDC61Q9Y6R9 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
CCDC61Q9Y6R9 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
CCDC61Q9Y6R9 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
CCDC61Q9Y6R9 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
CCDC61Q9Y6R9 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
CCDC61Q9Y6R9 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
CCDC61Q9Y6R9 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
CCDC61Q9Y6R9 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
CCDC61Q9Y6R9 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
CCDC61Q9Y6R9 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
CCDC61Q9Y6R9 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
CCDC61Q9Y6R9 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC30.46■■■□□ 2.47
CCDC61Q9Y6R9 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
CCDC61Q9Y6R9 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
CCDC61Q9Y6R9 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
CCDC61Q9Y6R9 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
CCDC61Q9Y6R9 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC30.45■■■□□ 2.47
CCDC61Q9Y6R9 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC30.45■■■□□ 2.47
CCDC61Q9Y6R9 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC30.45■■■□□ 2.47
CCDC61Q9Y6R9 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.46
CCDC61Q9Y6R9 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.46
CCDC61Q9Y6R9 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
CCDC61Q9Y6R9 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
CCDC61Q9Y6R9 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
CCDC61Q9Y6R9 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
CCDC61Q9Y6R9 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
CCDC61Q9Y6R9 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
CCDC61Q9Y6R9 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
CCDC61Q9Y6R9 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
CCDC61Q9Y6R9 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
CCDC61Q9Y6R9 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
CCDC61Q9Y6R9 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
CCDC61Q9Y6R9 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
CCDC61Q9Y6R9 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
CCDC61Q9Y6R9 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC30.43■■■□□ 2.46
CCDC61Q9Y6R9 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
CCDC61Q9Y6R9 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
CCDC61Q9Y6R9 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
CCDC61Q9Y6R9 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
CCDC61Q9Y6R9 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
CCDC61Q9Y6R9 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
CCDC61Q9Y6R9 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
CCDC61Q9Y6R9 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
CCDC61Q9Y6R9 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
CCDC61Q9Y6R9 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
CCDC61Q9Y6R9 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
CCDC61Q9Y6R9 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
CCDC61Q9Y6R9 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
CCDC61Q9Y6R9 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
CCDC61Q9Y6R9 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
CCDC61Q9Y6R9 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
CCDC61Q9Y6R9 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
CCDC61Q9Y6R9 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC30.41■■■□□ 2.46
CCDC61Q9Y6R9 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC30.41■■■□□ 2.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms