Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6F1

PARP3, Poly [ADP-ribose] polymerase 3, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP3Q9Y6F1 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PARP3Q9Y6F1 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PARP3Q9Y6F1 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PARP3Q9Y6F1 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PARP3Q9Y6F1 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PARP3Q9Y6F1 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
PARP3Q9Y6F1 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PARP3Q9Y6F1 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PARP3Q9Y6F1 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PARP3Q9Y6F1 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PARP3Q9Y6F1 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PARP3Q9Y6F1 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PARP3Q9Y6F1 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PARP3Q9Y6F1 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PARP3Q9Y6F1 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PARP3Q9Y6F1 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PARP3Q9Y6F1 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PARP3Q9Y6F1 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
PARP3Q9Y6F1 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PARP3Q9Y6F1 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PARP3Q9Y6F1 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PARP3Q9Y6F1 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PARP3Q9Y6F1 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PARP3Q9Y6F1 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
PARP3Q9Y6F1 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PARP3Q9Y6F1 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PARP3Q9Y6F1 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PARP3Q9Y6F1 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PARP3Q9Y6F1 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PARP3Q9Y6F1 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PARP3Q9Y6F1 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PARP3Q9Y6F1 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PARP3Q9Y6F1 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PARP3Q9Y6F1 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PARP3Q9Y6F1 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PARP3Q9Y6F1 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PARP3Q9Y6F1 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PARP3Q9Y6F1 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PARP3Q9Y6F1 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PARP3Q9Y6F1 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PARP3Q9Y6F1 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PARP3Q9Y6F1 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PARP3Q9Y6F1 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PARP3Q9Y6F1 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PARP3Q9Y6F1 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PARP3Q9Y6F1 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PARP3Q9Y6F1 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PARP3Q9Y6F1 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PARP3Q9Y6F1 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PARP3Q9Y6F1 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PARP3Q9Y6F1 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PARP3Q9Y6F1 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PARP3Q9Y6F1 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PARP3Q9Y6F1 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PARP3Q9Y6F1 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PARP3Q9Y6F1 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PARP3Q9Y6F1 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PARP3Q9Y6F1 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PARP3Q9Y6F1 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PARP3Q9Y6F1 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PARP3Q9Y6F1 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PARP3Q9Y6F1 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PARP3Q9Y6F1 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PARP3Q9Y6F1 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PARP3Q9Y6F1 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PARP3Q9Y6F1 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PARP3Q9Y6F1 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PARP3Q9Y6F1 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PARP3Q9Y6F1 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PARP3Q9Y6F1 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PARP3Q9Y6F1 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PARP3Q9Y6F1 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PARP3Q9Y6F1 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PARP3Q9Y6F1 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PARP3Q9Y6F1 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
PARP3Q9Y6F1 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PARP3Q9Y6F1 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PARP3Q9Y6F1 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PARP3Q9Y6F1 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PARP3Q9Y6F1 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PARP3Q9Y6F1 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PARP3Q9Y6F1 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PARP3Q9Y6F1 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PARP3Q9Y6F1 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PARP3Q9Y6F1 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PARP3Q9Y6F1 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PARP3Q9Y6F1 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PARP3Q9Y6F1 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PARP3Q9Y6F1 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PARP3Q9Y6F1 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PARP3Q9Y6F1 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PARP3Q9Y6F1 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PARP3Q9Y6F1 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PARP3Q9Y6F1 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PARP3Q9Y6F1 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PARP3Q9Y6F1 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PARP3Q9Y6F1 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PARP3Q9Y6F1 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PARP3Q9Y6F1 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PARP3Q9Y6F1 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms