Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
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SNX13Q9Y5W8 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
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SNX13Q9Y5W8 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
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SNX13Q9Y5W8 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SNX13Q9Y5W8 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SNX13Q9Y5W8 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SNX13Q9Y5W8 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SNX13Q9Y5W8 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SNX13Q9Y5W8 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SNX13Q9Y5W8 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SNX13Q9Y5W8 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SNX13Q9Y5W8 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SNX13Q9Y5W8 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SNX13Q9Y5W8 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SNX13Q9Y5W8 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SNX13Q9Y5W8 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
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