Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5E1

PCDHB9, Protocadherin beta-9, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB9Q9Y5E1 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCDHB9Q9Y5E1 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PCDHB9Q9Y5E1 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PCDHB9Q9Y5E1 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PCDHB9Q9Y5E1 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCDHB9Q9Y5E1 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCDHB9Q9Y5E1 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCDHB9Q9Y5E1 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCDHB9Q9Y5E1 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCDHB9Q9Y5E1 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCDHB9Q9Y5E1 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCDHB9Q9Y5E1 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCDHB9Q9Y5E1 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCDHB9Q9Y5E1 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCDHB9Q9Y5E1 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCDHB9Q9Y5E1 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCDHB9Q9Y5E1 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCDHB9Q9Y5E1 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCDHB9Q9Y5E1 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PCDHB9Q9Y5E1 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCDHB9Q9Y5E1 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCDHB9Q9Y5E1 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCDHB9Q9Y5E1 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCDHB9Q9Y5E1 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCDHB9Q9Y5E1 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PCDHB9Q9Y5E1 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCDHB9Q9Y5E1 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCDHB9Q9Y5E1 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PCDHB9Q9Y5E1 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PCDHB9Q9Y5E1 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCDHB9Q9Y5E1 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCDHB9Q9Y5E1 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCDHB9Q9Y5E1 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCDHB9Q9Y5E1 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCDHB9Q9Y5E1 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCDHB9Q9Y5E1 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCDHB9Q9Y5E1 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCDHB9Q9Y5E1 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCDHB9Q9Y5E1 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCDHB9Q9Y5E1 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCDHB9Q9Y5E1 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCDHB9Q9Y5E1 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCDHB9Q9Y5E1 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCDHB9Q9Y5E1 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCDHB9Q9Y5E1 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCDHB9Q9Y5E1 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCDHB9Q9Y5E1 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCDHB9Q9Y5E1 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PCDHB9Q9Y5E1 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCDHB9Q9Y5E1 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCDHB9Q9Y5E1 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCDHB9Q9Y5E1 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCDHB9Q9Y5E1 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCDHB9Q9Y5E1 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCDHB9Q9Y5E1 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCDHB9Q9Y5E1 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCDHB9Q9Y5E1 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCDHB9Q9Y5E1 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCDHB9Q9Y5E1 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCDHB9Q9Y5E1 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCDHB9Q9Y5E1 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCDHB9Q9Y5E1 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCDHB9Q9Y5E1 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCDHB9Q9Y5E1 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCDHB9Q9Y5E1 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCDHB9Q9Y5E1 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCDHB9Q9Y5E1 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCDHB9Q9Y5E1 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCDHB9Q9Y5E1 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCDHB9Q9Y5E1 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PCDHB9Q9Y5E1 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCDHB9Q9Y5E1 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCDHB9Q9Y5E1 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCDHB9Q9Y5E1 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCDHB9Q9Y5E1 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCDHB9Q9Y5E1 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCDHB9Q9Y5E1 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCDHB9Q9Y5E1 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCDHB9Q9Y5E1 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCDHB9Q9Y5E1 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCDHB9Q9Y5E1 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCDHB9Q9Y5E1 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PCDHB9Q9Y5E1 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCDHB9Q9Y5E1 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCDHB9Q9Y5E1 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCDHB9Q9Y5E1 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCDHB9Q9Y5E1 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCDHB9Q9Y5E1 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCDHB9Q9Y5E1 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PCDHB9Q9Y5E1 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PCDHB9Q9Y5E1 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PCDHB9Q9Y5E1 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PCDHB9Q9Y5E1 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PCDHB9Q9Y5E1 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PCDHB9Q9Y5E1 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PCDHB9Q9Y5E1 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCDHB9Q9Y5E1 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCDHB9Q9Y5E1 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCDHB9Q9Y5E1 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCDHB9Q9Y5E1 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms