Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B7

MRPL11, 39S ribosomal protein L11, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL11Q9Y3B7 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MRPL11Q9Y3B7 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MRPL11Q9Y3B7 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MRPL11Q9Y3B7 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MRPL11Q9Y3B7 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
MRPL11Q9Y3B7 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
MRPL11Q9Y3B7 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
MRPL11Q9Y3B7 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MRPL11Q9Y3B7 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MRPL11Q9Y3B7 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MRPL11Q9Y3B7 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
MRPL11Q9Y3B7 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MRPL11Q9Y3B7 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MRPL11Q9Y3B7 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MRPL11Q9Y3B7 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MRPL11Q9Y3B7 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MRPL11Q9Y3B7 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MRPL11Q9Y3B7 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MRPL11Q9Y3B7 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MRPL11Q9Y3B7 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MRPL11Q9Y3B7 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MRPL11Q9Y3B7 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MRPL11Q9Y3B7 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MRPL11Q9Y3B7 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MRPL11Q9Y3B7 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MRPL11Q9Y3B7 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MRPL11Q9Y3B7 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MRPL11Q9Y3B7 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MRPL11Q9Y3B7 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
MRPL11Q9Y3B7 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MRPL11Q9Y3B7 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MRPL11Q9Y3B7 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MRPL11Q9Y3B7 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MRPL11Q9Y3B7 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MRPL11Q9Y3B7 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MRPL11Q9Y3B7 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MRPL11Q9Y3B7 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MRPL11Q9Y3B7 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MRPL11Q9Y3B7 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MRPL11Q9Y3B7 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MRPL11Q9Y3B7 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MRPL11Q9Y3B7 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MRPL11Q9Y3B7 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MRPL11Q9Y3B7 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MRPL11Q9Y3B7 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MRPL11Q9Y3B7 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
MRPL11Q9Y3B7 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
MRPL11Q9Y3B7 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MRPL11Q9Y3B7 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MRPL11Q9Y3B7 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MRPL11Q9Y3B7 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MRPL11Q9Y3B7 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MRPL11Q9Y3B7 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MRPL11Q9Y3B7 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MRPL11Q9Y3B7 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MRPL11Q9Y3B7 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MRPL11Q9Y3B7 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MRPL11Q9Y3B7 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MRPL11Q9Y3B7 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MRPL11Q9Y3B7 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MRPL11Q9Y3B7 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MRPL11Q9Y3B7 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MRPL11Q9Y3B7 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MRPL11Q9Y3B7 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MRPL11Q9Y3B7 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MRPL11Q9Y3B7 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MRPL11Q9Y3B7 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MRPL11Q9Y3B7 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MRPL11Q9Y3B7 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MRPL11Q9Y3B7 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MRPL11Q9Y3B7 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MRPL11Q9Y3B7 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
MRPL11Q9Y3B7 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
MRPL11Q9Y3B7 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
MRPL11Q9Y3B7 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MRPL11Q9Y3B7 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MRPL11Q9Y3B7 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MRPL11Q9Y3B7 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MRPL11Q9Y3B7 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MRPL11Q9Y3B7 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MRPL11Q9Y3B7 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MRPL11Q9Y3B7 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MRPL11Q9Y3B7 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
MRPL11Q9Y3B7 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
MRPL11Q9Y3B7 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MRPL11Q9Y3B7 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MRPL11Q9Y3B7 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MRPL11Q9Y3B7 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MRPL11Q9Y3B7 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MRPL11Q9Y3B7 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MRPL11Q9Y3B7 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MRPL11Q9Y3B7 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MRPL11Q9Y3B7 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MRPL11Q9Y3B7 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MRPL11Q9Y3B7 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MRPL11Q9Y3B7 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MRPL11Q9Y3B7 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MRPL11Q9Y3B7 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MRPL11Q9Y3B7 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MRPL11Q9Y3B7 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms