Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2G3

ATP11B, Probable phospholipid-transporting ATPase IF, humanhuman

Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP11BQ9Y2G3 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATP11BQ9Y2G3 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATP11BQ9Y2G3 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATP11BQ9Y2G3 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATP11BQ9Y2G3 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATP11BQ9Y2G3 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATP11BQ9Y2G3 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATP11BQ9Y2G3 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATP11BQ9Y2G3 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
ATP11BQ9Y2G3 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATP11BQ9Y2G3 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATP11BQ9Y2G3 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATP11BQ9Y2G3 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATP11BQ9Y2G3 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATP11BQ9Y2G3 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATP11BQ9Y2G3 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATP11BQ9Y2G3 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
ATP11BQ9Y2G3 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATP11BQ9Y2G3 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP11BQ9Y2G3 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP11BQ9Y2G3 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP11BQ9Y2G3 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP11BQ9Y2G3 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP11BQ9Y2G3 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP11BQ9Y2G3 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP11BQ9Y2G3 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP11BQ9Y2G3 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP11BQ9Y2G3 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP11BQ9Y2G3 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP11BQ9Y2G3 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP11BQ9Y2G3 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP11BQ9Y2G3 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP11BQ9Y2G3 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP11BQ9Y2G3 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP11BQ9Y2G3 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP11BQ9Y2G3 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP11BQ9Y2G3 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP11BQ9Y2G3 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP11BQ9Y2G3 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP11BQ9Y2G3 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP11BQ9Y2G3 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP11BQ9Y2G3 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP11BQ9Y2G3 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP11BQ9Y2G3 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP11BQ9Y2G3 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP11BQ9Y2G3 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP11BQ9Y2G3 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ATP11BQ9Y2G3 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
ATP11BQ9Y2G3 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATP11BQ9Y2G3 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATP11BQ9Y2G3 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATP11BQ9Y2G3 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATP11BQ9Y2G3 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATP11BQ9Y2G3 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
ATP11BQ9Y2G3 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATP11BQ9Y2G3 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATP11BQ9Y2G3 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATP11BQ9Y2G3 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATP11BQ9Y2G3 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATP11BQ9Y2G3 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATP11BQ9Y2G3 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATP11BQ9Y2G3 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATP11BQ9Y2G3 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATP11BQ9Y2G3 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATP11BQ9Y2G3 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATP11BQ9Y2G3 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATP11BQ9Y2G3 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
ATP11BQ9Y2G3 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATP11BQ9Y2G3 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATP11BQ9Y2G3 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATP11BQ9Y2G3 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATP11BQ9Y2G3 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATP11BQ9Y2G3 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATP11BQ9Y2G3 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
ATP11BQ9Y2G3 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATP11BQ9Y2G3 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATP11BQ9Y2G3 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATP11BQ9Y2G3 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATP11BQ9Y2G3 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATP11BQ9Y2G3 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP11BQ9Y2G3 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP11BQ9Y2G3 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP11BQ9Y2G3 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP11BQ9Y2G3 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP11BQ9Y2G3 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP11BQ9Y2G3 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP11BQ9Y2G3 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP11BQ9Y2G3 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP11BQ9Y2G3 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP11BQ9Y2G3 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
ATP11BQ9Y2G3 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATP11BQ9Y2G3 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATP11BQ9Y2G3 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATP11BQ9Y2G3 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATP11BQ9Y2G3 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATP11BQ9Y2G3 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATP11BQ9Y2G3 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATP11BQ9Y2G3 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATP11BQ9Y2G3 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATP11BQ9Y2G3 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms