Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2D1

ATF5, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF5Q9Y2D1 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ATF5Q9Y2D1 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ATF5Q9Y2D1 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ATF5Q9Y2D1 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ATF5Q9Y2D1 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ATF5Q9Y2D1 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ATF5Q9Y2D1 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ATF5Q9Y2D1 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ATF5Q9Y2D1 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ATF5Q9Y2D1 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ATF5Q9Y2D1 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ATF5Q9Y2D1 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ATF5Q9Y2D1 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ATF5Q9Y2D1 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
ATF5Q9Y2D1 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ATF5Q9Y2D1 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ATF5Q9Y2D1 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
ATF5Q9Y2D1 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ATF5Q9Y2D1 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ATF5Q9Y2D1 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ATF5Q9Y2D1 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ATF5Q9Y2D1 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ATF5Q9Y2D1 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ATF5Q9Y2D1 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ATF5Q9Y2D1 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ATF5Q9Y2D1 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
ATF5Q9Y2D1 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ATF5Q9Y2D1 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ATF5Q9Y2D1 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ATF5Q9Y2D1 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
ATF5Q9Y2D1 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ATF5Q9Y2D1 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ATF5Q9Y2D1 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
ATF5Q9Y2D1 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ATF5Q9Y2D1 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ATF5Q9Y2D1 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ATF5Q9Y2D1 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ATF5Q9Y2D1 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ATF5Q9Y2D1 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ATF5Q9Y2D1 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ATF5Q9Y2D1 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ATF5Q9Y2D1 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ATF5Q9Y2D1 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ATF5Q9Y2D1 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ATF5Q9Y2D1 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ATF5Q9Y2D1 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ATF5Q9Y2D1 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ATF5Q9Y2D1 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ATF5Q9Y2D1 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ATF5Q9Y2D1 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ATF5Q9Y2D1 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ATF5Q9Y2D1 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
ATF5Q9Y2D1 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ATF5Q9Y2D1 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ATF5Q9Y2D1 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ATF5Q9Y2D1 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ATF5Q9Y2D1 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ATF5Q9Y2D1 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ATF5Q9Y2D1 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ATF5Q9Y2D1 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ATF5Q9Y2D1 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
ATF5Q9Y2D1 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
ATF5Q9Y2D1 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
ATF5Q9Y2D1 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ATF5Q9Y2D1 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ATF5Q9Y2D1 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ATF5Q9Y2D1 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ATF5Q9Y2D1 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ATF5Q9Y2D1 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ATF5Q9Y2D1 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ATF5Q9Y2D1 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ATF5Q9Y2D1 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ATF5Q9Y2D1 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ATF5Q9Y2D1 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ATF5Q9Y2D1 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ATF5Q9Y2D1 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ATF5Q9Y2D1 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ATF5Q9Y2D1 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ATF5Q9Y2D1 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ATF5Q9Y2D1 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ATF5Q9Y2D1 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ATF5Q9Y2D1 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ATF5Q9Y2D1 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC28■■■□□ 2.07
ATF5Q9Y2D1 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
ATF5Q9Y2D1 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC28■■■□□ 2.07
ATF5Q9Y2D1 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ATF5Q9Y2D1 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
ATF5Q9Y2D1 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
ATF5Q9Y2D1 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
ATF5Q9Y2D1 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ATF5Q9Y2D1 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ATF5Q9Y2D1 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
ATF5Q9Y2D1 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ATF5Q9Y2D1 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ATF5Q9Y2D1 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ATF5Q9Y2D1 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ATF5Q9Y2D1 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
ATF5Q9Y2D1 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ATF5Q9Y2D1 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ATF5Q9Y2D1 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.2 ms