Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y275

TNFSF13B, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 13B, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF13BQ9Y275 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNFSF13BQ9Y275 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TNFSF13BQ9Y275 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TNFSF13BQ9Y275 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TNFSF13BQ9Y275 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TNFSF13BQ9Y275 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TNFSF13BQ9Y275 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TNFSF13BQ9Y275 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TNFSF13BQ9Y275 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TNFSF13BQ9Y275 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TNFSF13BQ9Y275 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNFSF13BQ9Y275 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNFSF13BQ9Y275 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNFSF13BQ9Y275 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNFSF13BQ9Y275 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNFSF13BQ9Y275 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNFSF13BQ9Y275 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNFSF13BQ9Y275 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TNFSF13BQ9Y275 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNFSF13BQ9Y275 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNFSF13BQ9Y275 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNFSF13BQ9Y275 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNFSF13BQ9Y275 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNFSF13BQ9Y275 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNFSF13BQ9Y275 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
TNFSF13BQ9Y275 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNFSF13BQ9Y275 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNFSF13BQ9Y275 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNFSF13BQ9Y275 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNFSF13BQ9Y275 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TNFSF13BQ9Y275 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TNFSF13BQ9Y275 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TNFSF13BQ9Y275 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TNFSF13BQ9Y275 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TNFSF13BQ9Y275 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TNFSF13BQ9Y275 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TNFSF13BQ9Y275 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TNFSF13BQ9Y275 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TNFSF13BQ9Y275 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TNFSF13BQ9Y275 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TNFSF13BQ9Y275 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TNFSF13BQ9Y275 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TNFSF13BQ9Y275 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TNFSF13BQ9Y275 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TNFSF13BQ9Y275 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TNFSF13BQ9Y275 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TNFSF13BQ9Y275 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TNFSF13BQ9Y275 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TNFSF13BQ9Y275 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TNFSF13BQ9Y275 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TNFSF13BQ9Y275 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TNFSF13BQ9Y275 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TNFSF13BQ9Y275 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TNFSF13BQ9Y275 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TNFSF13BQ9Y275 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TNFSF13BQ9Y275 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
TNFSF13BQ9Y275 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TNFSF13BQ9Y275 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TNFSF13BQ9Y275 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TNFSF13BQ9Y275 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TNFSF13BQ9Y275 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TNFSF13BQ9Y275 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TNFSF13BQ9Y275 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TNFSF13BQ9Y275 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TNFSF13BQ9Y275 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TNFSF13BQ9Y275 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TNFSF13BQ9Y275 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TNFSF13BQ9Y275 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TNFSF13BQ9Y275 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TNFSF13BQ9Y275 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TNFSF13BQ9Y275 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TNFSF13BQ9Y275 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TNFSF13BQ9Y275 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TNFSF13BQ9Y275 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TNFSF13BQ9Y275 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
TNFSF13BQ9Y275 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TNFSF13BQ9Y275 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TNFSF13BQ9Y275 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TNFSF13BQ9Y275 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TNFSF13BQ9Y275 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TNFSF13BQ9Y275 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TNFSF13BQ9Y275 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TNFSF13BQ9Y275 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TNFSF13BQ9Y275 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TNFSF13BQ9Y275 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TNFSF13BQ9Y275 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TNFSF13BQ9Y275 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TNFSF13BQ9Y275 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TNFSF13BQ9Y275 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TNFSF13BQ9Y275 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TNFSF13BQ9Y275 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TNFSF13BQ9Y275 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TNFSF13BQ9Y275 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TNFSF13BQ9Y275 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
TNFSF13BQ9Y275 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TNFSF13BQ9Y275 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TNFSF13BQ9Y275 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TNFSF13BQ9Y275 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TNFSF13BQ9Y275 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TNFSF13BQ9Y275 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms