Protein–RNA interactions for Protein: Q9XRX5

HHLA3, HERV-H LTR-associating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHLA3Q9XRX5 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HHLA3Q9XRX5 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HHLA3Q9XRX5 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HHLA3Q9XRX5 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HHLA3Q9XRX5 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HHLA3Q9XRX5 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
HHLA3Q9XRX5 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HHLA3Q9XRX5 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HHLA3Q9XRX5 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HHLA3Q9XRX5 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HHLA3Q9XRX5 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HHLA3Q9XRX5 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HHLA3Q9XRX5 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HHLA3Q9XRX5 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HHLA3Q9XRX5 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HHLA3Q9XRX5 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HHLA3Q9XRX5 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HHLA3Q9XRX5 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HHLA3Q9XRX5 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HHLA3Q9XRX5 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HHLA3Q9XRX5 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HHLA3Q9XRX5 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HHLA3Q9XRX5 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HHLA3Q9XRX5 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HHLA3Q9XRX5 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HHLA3Q9XRX5 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HHLA3Q9XRX5 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HHLA3Q9XRX5 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HHLA3Q9XRX5 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HHLA3Q9XRX5 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HHLA3Q9XRX5 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HHLA3Q9XRX5 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HHLA3Q9XRX5 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HHLA3Q9XRX5 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HHLA3Q9XRX5 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HHLA3Q9XRX5 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HHLA3Q9XRX5 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HHLA3Q9XRX5 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HHLA3Q9XRX5 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HHLA3Q9XRX5 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HHLA3Q9XRX5 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HHLA3Q9XRX5 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HHLA3Q9XRX5 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HHLA3Q9XRX5 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HHLA3Q9XRX5 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HHLA3Q9XRX5 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HHLA3Q9XRX5 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HHLA3Q9XRX5 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HHLA3Q9XRX5 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HHLA3Q9XRX5 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HHLA3Q9XRX5 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HHLA3Q9XRX5 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HHLA3Q9XRX5 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HHLA3Q9XRX5 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HHLA3Q9XRX5 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HHLA3Q9XRX5 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HHLA3Q9XRX5 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HHLA3Q9XRX5 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HHLA3Q9XRX5 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HHLA3Q9XRX5 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HHLA3Q9XRX5 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HHLA3Q9XRX5 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HHLA3Q9XRX5 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HHLA3Q9XRX5 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HHLA3Q9XRX5 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HHLA3Q9XRX5 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HHLA3Q9XRX5 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HHLA3Q9XRX5 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HHLA3Q9XRX5 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HHLA3Q9XRX5 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HHLA3Q9XRX5 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HHLA3Q9XRX5 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HHLA3Q9XRX5 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HHLA3Q9XRX5 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HHLA3Q9XRX5 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HHLA3Q9XRX5 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HHLA3Q9XRX5 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HHLA3Q9XRX5 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HHLA3Q9XRX5 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HHLA3Q9XRX5 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HHLA3Q9XRX5 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HHLA3Q9XRX5 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HHLA3Q9XRX5 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HHLA3Q9XRX5 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HHLA3Q9XRX5 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HHLA3Q9XRX5 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HHLA3Q9XRX5 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HHLA3Q9XRX5 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HHLA3Q9XRX5 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HHLA3Q9XRX5 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HHLA3Q9XRX5 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HHLA3Q9XRX5 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HHLA3Q9XRX5 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HHLA3Q9XRX5 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HHLA3Q9XRX5 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HHLA3Q9XRX5 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HHLA3Q9XRX5 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HHLA3Q9XRX5 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
HHLA3Q9XRX5 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HHLA3Q9XRX5 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms