Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQE7

SMC3, Structural maintenance of chromosomes protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC3Q9UQE7 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SMC3Q9UQE7 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SMC3Q9UQE7 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SMC3Q9UQE7 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SMC3Q9UQE7 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SMC3Q9UQE7 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SMC3Q9UQE7 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
SMC3Q9UQE7 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SMC3Q9UQE7 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SMC3Q9UQE7 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SMC3Q9UQE7 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SMC3Q9UQE7 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SMC3Q9UQE7 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SMC3Q9UQE7 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SMC3Q9UQE7 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SMC3Q9UQE7 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SMC3Q9UQE7 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SMC3Q9UQE7 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SMC3Q9UQE7 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SMC3Q9UQE7 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
SMC3Q9UQE7 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SMC3Q9UQE7 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SMC3Q9UQE7 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SMC3Q9UQE7 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SMC3Q9UQE7 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SMC3Q9UQE7 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SMC3Q9UQE7 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SMC3Q9UQE7 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SMC3Q9UQE7 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SMC3Q9UQE7 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SMC3Q9UQE7 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SMC3Q9UQE7 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SMC3Q9UQE7 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SMC3Q9UQE7 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SMC3Q9UQE7 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SMC3Q9UQE7 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SMC3Q9UQE7 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SMC3Q9UQE7 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SMC3Q9UQE7 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SMC3Q9UQE7 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SMC3Q9UQE7 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SMC3Q9UQE7 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SMC3Q9UQE7 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SMC3Q9UQE7 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SMC3Q9UQE7 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SMC3Q9UQE7 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SMC3Q9UQE7 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SMC3Q9UQE7 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SMC3Q9UQE7 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SMC3Q9UQE7 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SMC3Q9UQE7 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SMC3Q9UQE7 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
SMC3Q9UQE7 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SMC3Q9UQE7 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SMC3Q9UQE7 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
SMC3Q9UQE7 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SMC3Q9UQE7 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SMC3Q9UQE7 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
SMC3Q9UQE7 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SMC3Q9UQE7 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SMC3Q9UQE7 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SMC3Q9UQE7 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SMC3Q9UQE7 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SMC3Q9UQE7 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SMC3Q9UQE7 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SMC3Q9UQE7 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SMC3Q9UQE7 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
SMC3Q9UQE7 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SMC3Q9UQE7 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SMC3Q9UQE7 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SMC3Q9UQE7 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SMC3Q9UQE7 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SMC3Q9UQE7 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SMC3Q9UQE7 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SMC3Q9UQE7 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SMC3Q9UQE7 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SMC3Q9UQE7 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SMC3Q9UQE7 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SMC3Q9UQE7 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SMC3Q9UQE7 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SMC3Q9UQE7 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SMC3Q9UQE7 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SMC3Q9UQE7 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SMC3Q9UQE7 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SMC3Q9UQE7 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SMC3Q9UQE7 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SMC3Q9UQE7 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SMC3Q9UQE7 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SMC3Q9UQE7 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
SMC3Q9UQE7 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
SMC3Q9UQE7 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SMC3Q9UQE7 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
SMC3Q9UQE7 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SMC3Q9UQE7 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SMC3Q9UQE7 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SMC3Q9UQE7 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SMC3Q9UQE7 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
SMC3Q9UQE7 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SMC3Q9UQE7 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SMC3Q9UQE7 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms