Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQB3

CTNND2, Catenin delta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNND2Q9UQB3 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CTNND2Q9UQB3 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTNND2Q9UQB3 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTNND2Q9UQB3 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTNND2Q9UQB3 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTNND2Q9UQB3 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTNND2Q9UQB3 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTNND2Q9UQB3 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CTNND2Q9UQB3 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CTNND2Q9UQB3 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CTNND2Q9UQB3 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CTNND2Q9UQB3 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CTNND2Q9UQB3 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CTNND2Q9UQB3 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CTNND2Q9UQB3 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CTNND2Q9UQB3 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CTNND2Q9UQB3 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CTNND2Q9UQB3 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CTNND2Q9UQB3 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTNND2Q9UQB3 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTNND2Q9UQB3 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTNND2Q9UQB3 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTNND2Q9UQB3 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTNND2Q9UQB3 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CTNND2Q9UQB3 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTNND2Q9UQB3 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTNND2Q9UQB3 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTNND2Q9UQB3 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTNND2Q9UQB3 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTNND2Q9UQB3 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTNND2Q9UQB3 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTNND2Q9UQB3 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTNND2Q9UQB3 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTNND2Q9UQB3 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTNND2Q9UQB3 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTNND2Q9UQB3 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTNND2Q9UQB3 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTNND2Q9UQB3 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CTNND2Q9UQB3 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CTNND2Q9UQB3 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CTNND2Q9UQB3 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CTNND2Q9UQB3 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CTNND2Q9UQB3 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CTNND2Q9UQB3 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CTNND2Q9UQB3 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CTNND2Q9UQB3 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CTNND2Q9UQB3 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CTNND2Q9UQB3 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CTNND2Q9UQB3 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CTNND2Q9UQB3 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CTNND2Q9UQB3 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CTNND2Q9UQB3 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CTNND2Q9UQB3 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CTNND2Q9UQB3 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CTNND2Q9UQB3 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CTNND2Q9UQB3 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CTNND2Q9UQB3 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CTNND2Q9UQB3 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CTNND2Q9UQB3 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CTNND2Q9UQB3 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CTNND2Q9UQB3 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CTNND2Q9UQB3 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CTNND2Q9UQB3 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CTNND2Q9UQB3 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CTNND2Q9UQB3 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CTNND2Q9UQB3 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CTNND2Q9UQB3 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CTNND2Q9UQB3 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CTNND2Q9UQB3 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CTNND2Q9UQB3 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CTNND2Q9UQB3 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CTNND2Q9UQB3 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CTNND2Q9UQB3 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CTNND2Q9UQB3 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CTNND2Q9UQB3 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CTNND2Q9UQB3 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CTNND2Q9UQB3 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CTNND2Q9UQB3 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CTNND2Q9UQB3 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CTNND2Q9UQB3 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CTNND2Q9UQB3 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CTNND2Q9UQB3 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CTNND2Q9UQB3 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CTNND2Q9UQB3 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CTNND2Q9UQB3 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CTNND2Q9UQB3 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CTNND2Q9UQB3 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CTNND2Q9UQB3 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CTNND2Q9UQB3 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CTNND2Q9UQB3 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CTNND2Q9UQB3 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CTNND2Q9UQB3 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CTNND2Q9UQB3 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CTNND2Q9UQB3 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CTNND2Q9UQB3 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
CTNND2Q9UQB3 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CTNND2Q9UQB3 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CTNND2Q9UQB3 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CTNND2Q9UQB3 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CTNND2Q9UQB3 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms