Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ90

SPG7, Paraplegin, humanhuman

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Length 795 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPG7Q9UQ90 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SPG7Q9UQ90 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SPG7Q9UQ90 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SPG7Q9UQ90 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SPG7Q9UQ90 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SPG7Q9UQ90 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SPG7Q9UQ90 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SPG7Q9UQ90 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SPG7Q9UQ90 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SPG7Q9UQ90 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SPG7Q9UQ90 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SPG7Q9UQ90 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SPG7Q9UQ90 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SPG7Q9UQ90 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SPG7Q9UQ90 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SPG7Q9UQ90 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SPG7Q9UQ90 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SPG7Q9UQ90 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SPG7Q9UQ90 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SPG7Q9UQ90 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SPG7Q9UQ90 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SPG7Q9UQ90 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SPG7Q9UQ90 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SPG7Q9UQ90 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SPG7Q9UQ90 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SPG7Q9UQ90 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SPG7Q9UQ90 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
SPG7Q9UQ90 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SPG7Q9UQ90 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SPG7Q9UQ90 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SPG7Q9UQ90 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
SPG7Q9UQ90 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SPG7Q9UQ90 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SPG7Q9UQ90 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SPG7Q9UQ90 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SPG7Q9UQ90 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SPG7Q9UQ90 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
SPG7Q9UQ90 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
SPG7Q9UQ90 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
SPG7Q9UQ90 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SPG7Q9UQ90 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SPG7Q9UQ90 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SPG7Q9UQ90 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SPG7Q9UQ90 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SPG7Q9UQ90 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SPG7Q9UQ90 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SPG7Q9UQ90 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
SPG7Q9UQ90 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SPG7Q9UQ90 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SPG7Q9UQ90 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SPG7Q9UQ90 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SPG7Q9UQ90 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
SPG7Q9UQ90 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SPG7Q9UQ90 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SPG7Q9UQ90 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SPG7Q9UQ90 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SPG7Q9UQ90 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SPG7Q9UQ90 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SPG7Q9UQ90 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SPG7Q9UQ90 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SPG7Q9UQ90 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SPG7Q9UQ90 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SPG7Q9UQ90 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SPG7Q9UQ90 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SPG7Q9UQ90 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SPG7Q9UQ90 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SPG7Q9UQ90 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SPG7Q9UQ90 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SPG7Q9UQ90 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SPG7Q9UQ90 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SPG7Q9UQ90 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SPG7Q9UQ90 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SPG7Q9UQ90 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SPG7Q9UQ90 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SPG7Q9UQ90 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SPG7Q9UQ90 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SPG7Q9UQ90 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SPG7Q9UQ90 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SPG7Q9UQ90 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SPG7Q9UQ90 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SPG7Q9UQ90 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SPG7Q9UQ90 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
SPG7Q9UQ90 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SPG7Q9UQ90 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SPG7Q9UQ90 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
SPG7Q9UQ90 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SPG7Q9UQ90 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SPG7Q9UQ90 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SPG7Q9UQ90 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SPG7Q9UQ90 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
SPG7Q9UQ90 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC29■■■□□ 2.23
SPG7Q9UQ90 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SPG7Q9UQ90 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
SPG7Q9UQ90 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
SPG7Q9UQ90 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SPG7Q9UQ90 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SPG7Q9UQ90 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SPG7Q9UQ90 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SPG7Q9UQ90 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SPG7Q9UQ90 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC28.99■■■□□ 2.23
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