Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ3

AGAP1, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP1Q9UPQ3 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
AGAP1Q9UPQ3 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
AGAP1Q9UPQ3 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
AGAP1Q9UPQ3 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
AGAP1Q9UPQ3 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
AGAP1Q9UPQ3 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
AGAP1Q9UPQ3 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
AGAP1Q9UPQ3 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
AGAP1Q9UPQ3 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
AGAP1Q9UPQ3 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
AGAP1Q9UPQ3 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
AGAP1Q9UPQ3 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
AGAP1Q9UPQ3 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
AGAP1Q9UPQ3 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
AGAP1Q9UPQ3 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
AGAP1Q9UPQ3 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
AGAP1Q9UPQ3 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
AGAP1Q9UPQ3 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
AGAP1Q9UPQ3 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
AGAP1Q9UPQ3 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
AGAP1Q9UPQ3 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
AGAP1Q9UPQ3 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
AGAP1Q9UPQ3 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
AGAP1Q9UPQ3 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
AGAP1Q9UPQ3 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
AGAP1Q9UPQ3 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
AGAP1Q9UPQ3 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
AGAP1Q9UPQ3 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
AGAP1Q9UPQ3 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
AGAP1Q9UPQ3 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
AGAP1Q9UPQ3 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
AGAP1Q9UPQ3 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
AGAP1Q9UPQ3 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
AGAP1Q9UPQ3 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
AGAP1Q9UPQ3 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
AGAP1Q9UPQ3 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
AGAP1Q9UPQ3 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
AGAP1Q9UPQ3 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
AGAP1Q9UPQ3 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
AGAP1Q9UPQ3 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
AGAP1Q9UPQ3 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
AGAP1Q9UPQ3 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
AGAP1Q9UPQ3 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
AGAP1Q9UPQ3 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
AGAP1Q9UPQ3 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
AGAP1Q9UPQ3 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
AGAP1Q9UPQ3 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
AGAP1Q9UPQ3 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.4
AGAP1Q9UPQ3 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
AGAP1Q9UPQ3 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
AGAP1Q9UPQ3 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
AGAP1Q9UPQ3 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
AGAP1Q9UPQ3 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
AGAP1Q9UPQ3 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
AGAP1Q9UPQ3 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
AGAP1Q9UPQ3 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
AGAP1Q9UPQ3 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
AGAP1Q9UPQ3 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
AGAP1Q9UPQ3 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
AGAP1Q9UPQ3 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
AGAP1Q9UPQ3 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
AGAP1Q9UPQ3 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
AGAP1Q9UPQ3 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
AGAP1Q9UPQ3 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
AGAP1Q9UPQ3 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
AGAP1Q9UPQ3 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
AGAP1Q9UPQ3 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
AGAP1Q9UPQ3 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
AGAP1Q9UPQ3 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
AGAP1Q9UPQ3 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
AGAP1Q9UPQ3 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
AGAP1Q9UPQ3 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
AGAP1Q9UPQ3 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
AGAP1Q9UPQ3 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
AGAP1Q9UPQ3 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
AGAP1Q9UPQ3 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
AGAP1Q9UPQ3 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
AGAP1Q9UPQ3 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
AGAP1Q9UPQ3 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
AGAP1Q9UPQ3 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
AGAP1Q9UPQ3 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
AGAP1Q9UPQ3 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
AGAP1Q9UPQ3 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
AGAP1Q9UPQ3 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
AGAP1Q9UPQ3 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
AGAP1Q9UPQ3 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
AGAP1Q9UPQ3 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
AGAP1Q9UPQ3 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
AGAP1Q9UPQ3 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
AGAP1Q9UPQ3 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
AGAP1Q9UPQ3 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
AGAP1Q9UPQ3 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
AGAP1Q9UPQ3 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
AGAP1Q9UPQ3 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
AGAP1Q9UPQ3 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
AGAP1Q9UPQ3 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
AGAP1Q9UPQ3 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
AGAP1Q9UPQ3 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
AGAP1Q9UPQ3 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
AGAP1Q9UPQ3 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms