Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT6

ZNRF3, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF3, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF3Q9ULT6 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ZNRF3Q9ULT6 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ZNRF3Q9ULT6 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ZNRF3Q9ULT6 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ZNRF3Q9ULT6 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
ZNRF3Q9ULT6 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ZNRF3Q9ULT6 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ZNRF3Q9ULT6 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ZNRF3Q9ULT6 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ZNRF3Q9ULT6 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ZNRF3Q9ULT6 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ZNRF3Q9ULT6 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ZNRF3Q9ULT6 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ZNRF3Q9ULT6 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ZNRF3Q9ULT6 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
ZNRF3Q9ULT6 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ZNRF3Q9ULT6 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ZNRF3Q9ULT6 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ZNRF3Q9ULT6 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ZNRF3Q9ULT6 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ZNRF3Q9ULT6 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ZNRF3Q9ULT6 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ZNRF3Q9ULT6 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
ZNRF3Q9ULT6 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ZNRF3Q9ULT6 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ZNRF3Q9ULT6 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ZNRF3Q9ULT6 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ZNRF3Q9ULT6 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
ZNRF3Q9ULT6 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ZNRF3Q9ULT6 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ZNRF3Q9ULT6 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ZNRF3Q9ULT6 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ZNRF3Q9ULT6 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ZNRF3Q9ULT6 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ZNRF3Q9ULT6 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ZNRF3Q9ULT6 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ZNRF3Q9ULT6 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
ZNRF3Q9ULT6 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ZNRF3Q9ULT6 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ZNRF3Q9ULT6 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ZNRF3Q9ULT6 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ZNRF3Q9ULT6 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ZNRF3Q9ULT6 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ZNRF3Q9ULT6 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ZNRF3Q9ULT6 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ZNRF3Q9ULT6 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
ZNRF3Q9ULT6 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ZNRF3Q9ULT6 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ZNRF3Q9ULT6 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
ZNRF3Q9ULT6 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ZNRF3Q9ULT6 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ZNRF3Q9ULT6 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ZNRF3Q9ULT6 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ZNRF3Q9ULT6 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ZNRF3Q9ULT6 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ZNRF3Q9ULT6 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ZNRF3Q9ULT6 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ZNRF3Q9ULT6 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ZNRF3Q9ULT6 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
ZNRF3Q9ULT6 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ZNRF3Q9ULT6 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ZNRF3Q9ULT6 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ZNRF3Q9ULT6 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
ZNRF3Q9ULT6 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
ZNRF3Q9ULT6 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ZNRF3Q9ULT6 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ZNRF3Q9ULT6 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ZNRF3Q9ULT6 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ZNRF3Q9ULT6 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ZNRF3Q9ULT6 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ZNRF3Q9ULT6 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ZNRF3Q9ULT6 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ZNRF3Q9ULT6 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ZNRF3Q9ULT6 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ZNRF3Q9ULT6 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ZNRF3Q9ULT6 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ZNRF3Q9ULT6 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ZNRF3Q9ULT6 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ZNRF3Q9ULT6 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ZNRF3Q9ULT6 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ZNRF3Q9ULT6 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ZNRF3Q9ULT6 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ZNRF3Q9ULT6 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ZNRF3Q9ULT6 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ZNRF3Q9ULT6 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ZNRF3Q9ULT6 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ZNRF3Q9ULT6 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ZNRF3Q9ULT6 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ZNRF3Q9ULT6 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ZNRF3Q9ULT6 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ZNRF3Q9ULT6 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ZNRF3Q9ULT6 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ZNRF3Q9ULT6 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ZNRF3Q9ULT6 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ZNRF3Q9ULT6 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ZNRF3Q9ULT6 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ZNRF3Q9ULT6 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ZNRF3Q9ULT6 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ZNRF3Q9ULT6 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ZNRF3Q9ULT6 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms