Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULK0

GRID1, Glutamate receptor ionotropic, delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,009 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRID1Q9ULK0 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRID1Q9ULK0 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRID1Q9ULK0 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRID1Q9ULK0 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRID1Q9ULK0 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRID1Q9ULK0 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GRID1Q9ULK0 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRID1Q9ULK0 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GRID1Q9ULK0 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRID1Q9ULK0 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRID1Q9ULK0 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRID1Q9ULK0 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRID1Q9ULK0 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GRID1Q9ULK0 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
GRID1Q9ULK0 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GRID1Q9ULK0 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GRID1Q9ULK0 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GRID1Q9ULK0 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GRID1Q9ULK0 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GRID1Q9ULK0 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GRID1Q9ULK0 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GRID1Q9ULK0 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GRID1Q9ULK0 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GRID1Q9ULK0 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GRID1Q9ULK0 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GRID1Q9ULK0 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GRID1Q9ULK0 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GRID1Q9ULK0 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GRID1Q9ULK0 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GRID1Q9ULK0 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GRID1Q9ULK0 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GRID1Q9ULK0 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GRID1Q9ULK0 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GRID1Q9ULK0 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GRID1Q9ULK0 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GRID1Q9ULK0 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GRID1Q9ULK0 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GRID1Q9ULK0 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GRID1Q9ULK0 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GRID1Q9ULK0 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GRID1Q9ULK0 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GRID1Q9ULK0 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GRID1Q9ULK0 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GRID1Q9ULK0 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GRID1Q9ULK0 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GRID1Q9ULK0 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GRID1Q9ULK0 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GRID1Q9ULK0 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GRID1Q9ULK0 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GRID1Q9ULK0 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GRID1Q9ULK0 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GRID1Q9ULK0 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GRID1Q9ULK0 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GRID1Q9ULK0 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GRID1Q9ULK0 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GRID1Q9ULK0 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
GRID1Q9ULK0 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
GRID1Q9ULK0 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GRID1Q9ULK0 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GRID1Q9ULK0 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GRID1Q9ULK0 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GRID1Q9ULK0 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GRID1Q9ULK0 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GRID1Q9ULK0 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GRID1Q9ULK0 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GRID1Q9ULK0 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GRID1Q9ULK0 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GRID1Q9ULK0 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GRID1Q9ULK0 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GRID1Q9ULK0 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GRID1Q9ULK0 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GRID1Q9ULK0 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GRID1Q9ULK0 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GRID1Q9ULK0 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GRID1Q9ULK0 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GRID1Q9ULK0 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GRID1Q9ULK0 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GRID1Q9ULK0 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GRID1Q9ULK0 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GRID1Q9ULK0 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GRID1Q9ULK0 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GRID1Q9ULK0 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GRID1Q9ULK0 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GRID1Q9ULK0 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GRID1Q9ULK0 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GRID1Q9ULK0 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
GRID1Q9ULK0 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GRID1Q9ULK0 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GRID1Q9ULK0 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GRID1Q9ULK0 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GRID1Q9ULK0 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
GRID1Q9ULK0 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GRID1Q9ULK0 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GRID1Q9ULK0 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GRID1Q9ULK0 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GRID1Q9ULK0 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GRID1Q9ULK0 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GRID1Q9ULK0 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
GRID1Q9ULK0 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
GRID1Q9ULK0 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms