Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKX3

MYH13, Myosin-13, humanhuman

Predictions only

Length 1,938 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYH13Q9UKX3 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MYH13Q9UKX3 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
MYH13Q9UKX3 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MYH13Q9UKX3 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MYH13Q9UKX3 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MYH13Q9UKX3 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MYH13Q9UKX3 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MYH13Q9UKX3 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MYH13Q9UKX3 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
MYH13Q9UKX3 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MYH13Q9UKX3 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
MYH13Q9UKX3 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
MYH13Q9UKX3 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MYH13Q9UKX3 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MYH13Q9UKX3 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
MYH13Q9UKX3 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MYH13Q9UKX3 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
MYH13Q9UKX3 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MYH13Q9UKX3 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
MYH13Q9UKX3 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
MYH13Q9UKX3 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
MYH13Q9UKX3 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
MYH13Q9UKX3 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
MYH13Q9UKX3 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
MYH13Q9UKX3 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MYH13Q9UKX3 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MYH13Q9UKX3 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
MYH13Q9UKX3 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MYH13Q9UKX3 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
MYH13Q9UKX3 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MYH13Q9UKX3 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MYH13Q9UKX3 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MYH13Q9UKX3 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
MYH13Q9UKX3 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
MYH13Q9UKX3 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MYH13Q9UKX3 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
MYH13Q9UKX3 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
MYH13Q9UKX3 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
MYH13Q9UKX3 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MYH13Q9UKX3 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
MYH13Q9UKX3 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MYH13Q9UKX3 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MYH13Q9UKX3 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
MYH13Q9UKX3 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MYH13Q9UKX3 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
MYH13Q9UKX3 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
MYH13Q9UKX3 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
MYH13Q9UKX3 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MYH13Q9UKX3 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
MYH13Q9UKX3 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
MYH13Q9UKX3 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
MYH13Q9UKX3 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC26.73■■□□□ 1.87
MYH13Q9UKX3 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
MYH13Q9UKX3 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MYH13Q9UKX3 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
MYH13Q9UKX3 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
MYH13Q9UKX3 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MYH13Q9UKX3 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
MYH13Q9UKX3 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MYH13Q9UKX3 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
MYH13Q9UKX3 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
MYH13Q9UKX3 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
MYH13Q9UKX3 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
MYH13Q9UKX3 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
MYH13Q9UKX3 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MYH13Q9UKX3 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MYH13Q9UKX3 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
MYH13Q9UKX3 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MYH13Q9UKX3 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
MYH13Q9UKX3 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MYH13Q9UKX3 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC26.71■■□□□ 1.87
MYH13Q9UKX3 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
MYH13Q9UKX3 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MYH13Q9UKX3 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MYH13Q9UKX3 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
MYH13Q9UKX3 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MYH13Q9UKX3 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
MYH13Q9UKX3 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
MYH13Q9UKX3 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
MYH13Q9UKX3 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
MYH13Q9UKX3 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
MYH13Q9UKX3 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
MYH13Q9UKX3 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
MYH13Q9UKX3 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
MYH13Q9UKX3 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
MYH13Q9UKX3 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
MYH13Q9UKX3 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MYH13Q9UKX3 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MYH13Q9UKX3 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
MYH13Q9UKX3 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MYH13Q9UKX3 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
MYH13Q9UKX3 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MYH13Q9UKX3 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
MYH13Q9UKX3 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MYH13Q9UKX3 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
MYH13Q9UKX3 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MYH13Q9UKX3 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MYH13Q9UKX3 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MYH13Q9UKX3 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MYH13Q9UKX3 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms