Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKV5

AMFR, E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, humanhuman

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMFRQ9UKV5 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
AMFRQ9UKV5 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
AMFRQ9UKV5 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
AMFRQ9UKV5 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
AMFRQ9UKV5 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
AMFRQ9UKV5 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
AMFRQ9UKV5 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
AMFRQ9UKV5 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
AMFRQ9UKV5 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
AMFRQ9UKV5 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
AMFRQ9UKV5 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
AMFRQ9UKV5 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
AMFRQ9UKV5 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
AMFRQ9UKV5 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
AMFRQ9UKV5 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
AMFRQ9UKV5 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
AMFRQ9UKV5 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
AMFRQ9UKV5 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
AMFRQ9UKV5 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
AMFRQ9UKV5 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
AMFRQ9UKV5 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
AMFRQ9UKV5 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
AMFRQ9UKV5 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
AMFRQ9UKV5 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
AMFRQ9UKV5 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
AMFRQ9UKV5 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
AMFRQ9UKV5 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
AMFRQ9UKV5 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
AMFRQ9UKV5 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
AMFRQ9UKV5 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
AMFRQ9UKV5 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
AMFRQ9UKV5 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
AMFRQ9UKV5 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
AMFRQ9UKV5 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
AMFRQ9UKV5 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
AMFRQ9UKV5 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
AMFRQ9UKV5 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
AMFRQ9UKV5 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
AMFRQ9UKV5 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
AMFRQ9UKV5 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
AMFRQ9UKV5 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
AMFRQ9UKV5 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
AMFRQ9UKV5 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
AMFRQ9UKV5 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
AMFRQ9UKV5 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
AMFRQ9UKV5 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
AMFRQ9UKV5 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
AMFRQ9UKV5 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
AMFRQ9UKV5 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
AMFRQ9UKV5 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
AMFRQ9UKV5 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
AMFRQ9UKV5 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
AMFRQ9UKV5 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
AMFRQ9UKV5 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
AMFRQ9UKV5 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
AMFRQ9UKV5 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
AMFRQ9UKV5 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
AMFRQ9UKV5 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
AMFRQ9UKV5 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
AMFRQ9UKV5 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
AMFRQ9UKV5 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
AMFRQ9UKV5 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
AMFRQ9UKV5 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
AMFRQ9UKV5 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
AMFRQ9UKV5 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
AMFRQ9UKV5 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
AMFRQ9UKV5 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
AMFRQ9UKV5 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
AMFRQ9UKV5 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
AMFRQ9UKV5 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
AMFRQ9UKV5 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
AMFRQ9UKV5 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
AMFRQ9UKV5 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
AMFRQ9UKV5 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
AMFRQ9UKV5 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
AMFRQ9UKV5 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
AMFRQ9UKV5 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
AMFRQ9UKV5 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
AMFRQ9UKV5 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
AMFRQ9UKV5 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
AMFRQ9UKV5 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
AMFRQ9UKV5 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
AMFRQ9UKV5 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
AMFRQ9UKV5 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
AMFRQ9UKV5 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
AMFRQ9UKV5 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
AMFRQ9UKV5 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
AMFRQ9UKV5 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
AMFRQ9UKV5 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
AMFRQ9UKV5 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
AMFRQ9UKV5 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
AMFRQ9UKV5 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
AMFRQ9UKV5 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
AMFRQ9UKV5 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
AMFRQ9UKV5 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AMFRQ9UKV5 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AMFRQ9UKV5 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AMFRQ9UKV5 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AMFRQ9UKV5 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
AMFRQ9UKV5 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms