Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJD0

RIMS3, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMS3Q9UJD0 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
RIMS3Q9UJD0 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RIMS3Q9UJD0 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RIMS3Q9UJD0 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
RIMS3Q9UJD0 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RIMS3Q9UJD0 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
RIMS3Q9UJD0 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RIMS3Q9UJD0 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
RIMS3Q9UJD0 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
RIMS3Q9UJD0 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
RIMS3Q9UJD0 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
RIMS3Q9UJD0 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.94
RIMS3Q9UJD0 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RIMS3Q9UJD0 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RIMS3Q9UJD0 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RIMS3Q9UJD0 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RIMS3Q9UJD0 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RIMS3Q9UJD0 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RIMS3Q9UJD0 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RIMS3Q9UJD0 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RIMS3Q9UJD0 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RIMS3Q9UJD0 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RIMS3Q9UJD0 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RIMS3Q9UJD0 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RIMS3Q9UJD0 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RIMS3Q9UJD0 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RIMS3Q9UJD0 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RIMS3Q9UJD0 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RIMS3Q9UJD0 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RIMS3Q9UJD0 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RIMS3Q9UJD0 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RIMS3Q9UJD0 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RIMS3Q9UJD0 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RIMS3Q9UJD0 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RIMS3Q9UJD0 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RIMS3Q9UJD0 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RIMS3Q9UJD0 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RIMS3Q9UJD0 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RIMS3Q9UJD0 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RIMS3Q9UJD0 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RIMS3Q9UJD0 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RIMS3Q9UJD0 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RIMS3Q9UJD0 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RIMS3Q9UJD0 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RIMS3Q9UJD0 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RIMS3Q9UJD0 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RIMS3Q9UJD0 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RIMS3Q9UJD0 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RIMS3Q9UJD0 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RIMS3Q9UJD0 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RIMS3Q9UJD0 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RIMS3Q9UJD0 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RIMS3Q9UJD0 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RIMS3Q9UJD0 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RIMS3Q9UJD0 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RIMS3Q9UJD0 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RIMS3Q9UJD0 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RIMS3Q9UJD0 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RIMS3Q9UJD0 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RIMS3Q9UJD0 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
RIMS3Q9UJD0 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RIMS3Q9UJD0 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RIMS3Q9UJD0 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RIMS3Q9UJD0 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RIMS3Q9UJD0 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RIMS3Q9UJD0 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RIMS3Q9UJD0 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
RIMS3Q9UJD0 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RIMS3Q9UJD0 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RIMS3Q9UJD0 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RIMS3Q9UJD0 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RIMS3Q9UJD0 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RIMS3Q9UJD0 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RIMS3Q9UJD0 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RIMS3Q9UJD0 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RIMS3Q9UJD0 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RIMS3Q9UJD0 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RIMS3Q9UJD0 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
RIMS3Q9UJD0 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RIMS3Q9UJD0 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
RIMS3Q9UJD0 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
RIMS3Q9UJD0 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
RIMS3Q9UJD0 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
RIMS3Q9UJD0 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
RIMS3Q9UJD0 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
RIMS3Q9UJD0 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
RIMS3Q9UJD0 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
RIMS3Q9UJD0 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RIMS3Q9UJD0 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RIMS3Q9UJD0 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RIMS3Q9UJD0 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RIMS3Q9UJD0 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RIMS3Q9UJD0 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RIMS3Q9UJD0 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RIMS3Q9UJD0 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RIMS3Q9UJD0 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RIMS3Q9UJD0 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RIMS3Q9UJD0 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
RIMS3Q9UJD0 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RIMS3Q9UJD0 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms