Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ99

CDH22, Cadherin-22, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH22Q9UJ99 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDH22Q9UJ99 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDH22Q9UJ99 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDH22Q9UJ99 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDH22Q9UJ99 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDH22Q9UJ99 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDH22Q9UJ99 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDH22Q9UJ99 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDH22Q9UJ99 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDH22Q9UJ99 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDH22Q9UJ99 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDH22Q9UJ99 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CDH22Q9UJ99 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDH22Q9UJ99 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDH22Q9UJ99 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CDH22Q9UJ99 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDH22Q9UJ99 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CDH22Q9UJ99 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDH22Q9UJ99 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDH22Q9UJ99 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDH22Q9UJ99 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDH22Q9UJ99 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CDH22Q9UJ99 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDH22Q9UJ99 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDH22Q9UJ99 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDH22Q9UJ99 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDH22Q9UJ99 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDH22Q9UJ99 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDH22Q9UJ99 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDH22Q9UJ99 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CDH22Q9UJ99 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDH22Q9UJ99 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDH22Q9UJ99 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDH22Q9UJ99 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CDH22Q9UJ99 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDH22Q9UJ99 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDH22Q9UJ99 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CDH22Q9UJ99 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDH22Q9UJ99 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CDH22Q9UJ99 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CDH22Q9UJ99 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDH22Q9UJ99 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDH22Q9UJ99 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDH22Q9UJ99 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDH22Q9UJ99 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDH22Q9UJ99 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDH22Q9UJ99 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDH22Q9UJ99 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDH22Q9UJ99 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDH22Q9UJ99 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CDH22Q9UJ99 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDH22Q9UJ99 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDH22Q9UJ99 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDH22Q9UJ99 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDH22Q9UJ99 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDH22Q9UJ99 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDH22Q9UJ99 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDH22Q9UJ99 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDH22Q9UJ99 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDH22Q9UJ99 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDH22Q9UJ99 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDH22Q9UJ99 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDH22Q9UJ99 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDH22Q9UJ99 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDH22Q9UJ99 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDH22Q9UJ99 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDH22Q9UJ99 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDH22Q9UJ99 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDH22Q9UJ99 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDH22Q9UJ99 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDH22Q9UJ99 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDH22Q9UJ99 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDH22Q9UJ99 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDH22Q9UJ99 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDH22Q9UJ99 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDH22Q9UJ99 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDH22Q9UJ99 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDH22Q9UJ99 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDH22Q9UJ99 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDH22Q9UJ99 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDH22Q9UJ99 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDH22Q9UJ99 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDH22Q9UJ99 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDH22Q9UJ99 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDH22Q9UJ99 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDH22Q9UJ99 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDH22Q9UJ99 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDH22Q9UJ99 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDH22Q9UJ99 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDH22Q9UJ99 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDH22Q9UJ99 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDH22Q9UJ99 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDH22Q9UJ99 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDH22Q9UJ99 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDH22Q9UJ99 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDH22Q9UJ99 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDH22Q9UJ99 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDH22Q9UJ99 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CDH22Q9UJ99 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDH22Q9UJ99 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms