Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHP3

USP25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, humanhuman

Predictions only

Length 1,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25Q9UHP3 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP25Q9UHP3 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP25Q9UHP3 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP25Q9UHP3 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP25Q9UHP3 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP25Q9UHP3 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP25Q9UHP3 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP25Q9UHP3 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP25Q9UHP3 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP25Q9UHP3 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP25Q9UHP3 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP25Q9UHP3 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP25Q9UHP3 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP25Q9UHP3 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP25Q9UHP3 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP25Q9UHP3 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP25Q9UHP3 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP25Q9UHP3 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP25Q9UHP3 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
USP25Q9UHP3 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP25Q9UHP3 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP25Q9UHP3 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP25Q9UHP3 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP25Q9UHP3 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP25Q9UHP3 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP25Q9UHP3 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP25Q9UHP3 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP25Q9UHP3 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP25Q9UHP3 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP25Q9UHP3 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP25Q9UHP3 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP25Q9UHP3 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP25Q9UHP3 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP25Q9UHP3 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP25Q9UHP3 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
USP25Q9UHP3 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP25Q9UHP3 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP25Q9UHP3 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP25Q9UHP3 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP25Q9UHP3 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP25Q9UHP3 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP25Q9UHP3 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP25Q9UHP3 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP25Q9UHP3 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP25Q9UHP3 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
USP25Q9UHP3 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP25Q9UHP3 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
USP25Q9UHP3 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP25Q9UHP3 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP25Q9UHP3 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP25Q9UHP3 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP25Q9UHP3 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP25Q9UHP3 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP25Q9UHP3 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
USP25Q9UHP3 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP25Q9UHP3 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP25Q9UHP3 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP25Q9UHP3 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP25Q9UHP3 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP25Q9UHP3 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP25Q9UHP3 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP25Q9UHP3 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP25Q9UHP3 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP25Q9UHP3 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP25Q9UHP3 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
USP25Q9UHP3 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
USP25Q9UHP3 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
USP25Q9UHP3 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
USP25Q9UHP3 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
USP25Q9UHP3 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
USP25Q9UHP3 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
USP25Q9UHP3 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
USP25Q9UHP3 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
USP25Q9UHP3 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
USP25Q9UHP3 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
USP25Q9UHP3 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
USP25Q9UHP3 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
USP25Q9UHP3 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
USP25Q9UHP3 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
USP25Q9UHP3 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
USP25Q9UHP3 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
USP25Q9UHP3 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
USP25Q9UHP3 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
USP25Q9UHP3 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
USP25Q9UHP3 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
USP25Q9UHP3 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
USP25Q9UHP3 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP25Q9UHP3 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP25Q9UHP3 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP25Q9UHP3 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP25Q9UHP3 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP25Q9UHP3 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP25Q9UHP3 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP25Q9UHP3 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP25Q9UHP3 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP25Q9UHP3 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP25Q9UHP3 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP25Q9UHP3 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
USP25Q9UHP3 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP25Q9UHP3 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms