Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHF7

TRPS1, Zinc finger transcription factor Trps1, humanhuman

Predictions only

Length 1,281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1Q9UHF7 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TRPS1Q9UHF7 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TRPS1Q9UHF7 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRPS1Q9UHF7 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRPS1Q9UHF7 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TRPS1Q9UHF7 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRPS1Q9UHF7 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRPS1Q9UHF7 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRPS1Q9UHF7 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TRPS1Q9UHF7 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRPS1Q9UHF7 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TRPS1Q9UHF7 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TRPS1Q9UHF7 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRPS1Q9UHF7 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TRPS1Q9UHF7 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
TRPS1Q9UHF7 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TRPS1Q9UHF7 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRPS1Q9UHF7 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRPS1Q9UHF7 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRPS1Q9UHF7 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRPS1Q9UHF7 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TRPS1Q9UHF7 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TRPS1Q9UHF7 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRPS1Q9UHF7 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TRPS1Q9UHF7 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TRPS1Q9UHF7 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TRPS1Q9UHF7 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TRPS1Q9UHF7 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TRPS1Q9UHF7 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRPS1Q9UHF7 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TRPS1Q9UHF7 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TRPS1Q9UHF7 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRPS1Q9UHF7 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRPS1Q9UHF7 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
TRPS1Q9UHF7 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRPS1Q9UHF7 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TRPS1Q9UHF7 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TRPS1Q9UHF7 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TRPS1Q9UHF7 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TRPS1Q9UHF7 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TRPS1Q9UHF7 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
TRPS1Q9UHF7 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRPS1Q9UHF7 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
TRPS1Q9UHF7 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRPS1Q9UHF7 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TRPS1Q9UHF7 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRPS1Q9UHF7 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRPS1Q9UHF7 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TRPS1Q9UHF7 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRPS1Q9UHF7 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRPS1Q9UHF7 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRPS1Q9UHF7 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRPS1Q9UHF7 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TRPS1Q9UHF7 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TRPS1Q9UHF7 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TRPS1Q9UHF7 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRPS1Q9UHF7 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRPS1Q9UHF7 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TRPS1Q9UHF7 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TRPS1Q9UHF7 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TRPS1Q9UHF7 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRPS1Q9UHF7 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRPS1Q9UHF7 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRPS1Q9UHF7 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TRPS1Q9UHF7 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRPS1Q9UHF7 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TRPS1Q9UHF7 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TRPS1Q9UHF7 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRPS1Q9UHF7 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TRPS1Q9UHF7 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRPS1Q9UHF7 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRPS1Q9UHF7 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TRPS1Q9UHF7 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
TRPS1Q9UHF7 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TRPS1Q9UHF7 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
TRPS1Q9UHF7 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
TRPS1Q9UHF7 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRPS1Q9UHF7 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRPS1Q9UHF7 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRPS1Q9UHF7 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRPS1Q9UHF7 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TRPS1Q9UHF7 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRPS1Q9UHF7 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRPS1Q9UHF7 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRPS1Q9UHF7 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRPS1Q9UHF7 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRPS1Q9UHF7 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRPS1Q9UHF7 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRPS1Q9UHF7 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRPS1Q9UHF7 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRPS1Q9UHF7 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRPS1Q9UHF7 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRPS1Q9UHF7 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRPS1Q9UHF7 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRPS1Q9UHF7 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TRPS1Q9UHF7 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRPS1Q9UHF7 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TRPS1Q9UHF7 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRPS1Q9UHF7 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRPS1Q9UHF7 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms