Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGU5

HMGXB4, HMG domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGXB4Q9UGU5 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HMGXB4Q9UGU5 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
HMGXB4Q9UGU5 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
HMGXB4Q9UGU5 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HMGXB4Q9UGU5 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
HMGXB4Q9UGU5 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HMGXB4Q9UGU5 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HMGXB4Q9UGU5 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HMGXB4Q9UGU5 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HMGXB4Q9UGU5 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HMGXB4Q9UGU5 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HMGXB4Q9UGU5 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HMGXB4Q9UGU5 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HMGXB4Q9UGU5 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
HMGXB4Q9UGU5 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HMGXB4Q9UGU5 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HMGXB4Q9UGU5 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HMGXB4Q9UGU5 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HMGXB4Q9UGU5 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HMGXB4Q9UGU5 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HMGXB4Q9UGU5 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HMGXB4Q9UGU5 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HMGXB4Q9UGU5 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HMGXB4Q9UGU5 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HMGXB4Q9UGU5 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HMGXB4Q9UGU5 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
HMGXB4Q9UGU5 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HMGXB4Q9UGU5 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HMGXB4Q9UGU5 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HMGXB4Q9UGU5 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HMGXB4Q9UGU5 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HMGXB4Q9UGU5 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HMGXB4Q9UGU5 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HMGXB4Q9UGU5 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HMGXB4Q9UGU5 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HMGXB4Q9UGU5 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
HMGXB4Q9UGU5 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HMGXB4Q9UGU5 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HMGXB4Q9UGU5 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
HMGXB4Q9UGU5 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HMGXB4Q9UGU5 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HMGXB4Q9UGU5 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HMGXB4Q9UGU5 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HMGXB4Q9UGU5 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HMGXB4Q9UGU5 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HMGXB4Q9UGU5 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
HMGXB4Q9UGU5 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
HMGXB4Q9UGU5 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HMGXB4Q9UGU5 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HMGXB4Q9UGU5 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HMGXB4Q9UGU5 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HMGXB4Q9UGU5 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HMGXB4Q9UGU5 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HMGXB4Q9UGU5 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HMGXB4Q9UGU5 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HMGXB4Q9UGU5 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
HMGXB4Q9UGU5 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HMGXB4Q9UGU5 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HMGXB4Q9UGU5 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HMGXB4Q9UGU5 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HMGXB4Q9UGU5 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HMGXB4Q9UGU5 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HMGXB4Q9UGU5 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
HMGXB4Q9UGU5 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HMGXB4Q9UGU5 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HMGXB4Q9UGU5 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HMGXB4Q9UGU5 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HMGXB4Q9UGU5 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HMGXB4Q9UGU5 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HMGXB4Q9UGU5 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HMGXB4Q9UGU5 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HMGXB4Q9UGU5 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HMGXB4Q9UGU5 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HMGXB4Q9UGU5 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HMGXB4Q9UGU5 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HMGXB4Q9UGU5 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
HMGXB4Q9UGU5 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HMGXB4Q9UGU5 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HMGXB4Q9UGU5 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HMGXB4Q9UGU5 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HMGXB4Q9UGU5 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HMGXB4Q9UGU5 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HMGXB4Q9UGU5 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HMGXB4Q9UGU5 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HMGXB4Q9UGU5 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HMGXB4Q9UGU5 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HMGXB4Q9UGU5 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HMGXB4Q9UGU5 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HMGXB4Q9UGU5 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HMGXB4Q9UGU5 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HMGXB4Q9UGU5 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HMGXB4Q9UGU5 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HMGXB4Q9UGU5 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HMGXB4Q9UGU5 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
HMGXB4Q9UGU5 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HMGXB4Q9UGU5 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HMGXB4Q9UGU5 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
HMGXB4Q9UGU5 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HMGXB4Q9UGU5 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
HMGXB4Q9UGU5 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms