Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG63

ABCF2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCF2Q9UG63 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ABCF2Q9UG63 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
ABCF2Q9UG63 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ABCF2Q9UG63 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
ABCF2Q9UG63 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ABCF2Q9UG63 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
ABCF2Q9UG63 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ABCF2Q9UG63 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ABCF2Q9UG63 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ABCF2Q9UG63 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ABCF2Q9UG63 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.87
ABCF2Q9UG63 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
ABCF2Q9UG63 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
ABCF2Q9UG63 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ABCF2Q9UG63 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ABCF2Q9UG63 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ABCF2Q9UG63 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ABCF2Q9UG63 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ABCF2Q9UG63 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ABCF2Q9UG63 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ABCF2Q9UG63 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ABCF2Q9UG63 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
ABCF2Q9UG63 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ABCF2Q9UG63 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ABCF2Q9UG63 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ABCF2Q9UG63 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ABCF2Q9UG63 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ABCF2Q9UG63 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ABCF2Q9UG63 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ABCF2Q9UG63 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ABCF2Q9UG63 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ABCF2Q9UG63 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
ABCF2Q9UG63 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ABCF2Q9UG63 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ABCF2Q9UG63 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ABCF2Q9UG63 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ABCF2Q9UG63 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ABCF2Q9UG63 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ABCF2Q9UG63 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ABCF2Q9UG63 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ABCF2Q9UG63 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ABCF2Q9UG63 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ABCF2Q9UG63 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ABCF2Q9UG63 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ABCF2Q9UG63 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ABCF2Q9UG63 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ABCF2Q9UG63 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ABCF2Q9UG63 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ABCF2Q9UG63 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ABCF2Q9UG63 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ABCF2Q9UG63 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ABCF2Q9UG63 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ABCF2Q9UG63 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ABCF2Q9UG63 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ABCF2Q9UG63 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ABCF2Q9UG63 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ABCF2Q9UG63 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ABCF2Q9UG63 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ABCF2Q9UG63 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ABCF2Q9UG63 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ABCF2Q9UG63 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ABCF2Q9UG63 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ABCF2Q9UG63 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ABCF2Q9UG63 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ABCF2Q9UG63 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
ABCF2Q9UG63 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ABCF2Q9UG63 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ABCF2Q9UG63 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ABCF2Q9UG63 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ABCF2Q9UG63 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ABCF2Q9UG63 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ABCF2Q9UG63 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ABCF2Q9UG63 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
ABCF2Q9UG63 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ABCF2Q9UG63 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ABCF2Q9UG63 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
ABCF2Q9UG63 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
ABCF2Q9UG63 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
ABCF2Q9UG63 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ABCF2Q9UG63 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ABCF2Q9UG63 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ABCF2Q9UG63 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ABCF2Q9UG63 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ABCF2Q9UG63 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ABCF2Q9UG63 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ABCF2Q9UG63 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ABCF2Q9UG63 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ABCF2Q9UG63 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ABCF2Q9UG63 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ABCF2Q9UG63 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ABCF2Q9UG63 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
ABCF2Q9UG63 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ABCF2Q9UG63 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ABCF2Q9UG63 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ABCF2Q9UG63 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ABCF2Q9UG63 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ABCF2Q9UG63 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ABCF2Q9UG63 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ABCF2Q9UG63 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ABCF2Q9UG63 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms