Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG01

IFT172, Intraflagellar transport protein 172 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT172Q9UG01 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
IFT172Q9UG01 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
IFT172Q9UG01 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
IFT172Q9UG01 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
IFT172Q9UG01 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC31.66■■■□□ 2.66
IFT172Q9UG01 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
IFT172Q9UG01 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
IFT172Q9UG01 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
IFT172Q9UG01 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
IFT172Q9UG01 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
IFT172Q9UG01 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
IFT172Q9UG01 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC31.65■■■□□ 2.66
IFT172Q9UG01 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC31.65■■■□□ 2.66
IFT172Q9UG01 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
IFT172Q9UG01 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
IFT172Q9UG01 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
IFT172Q9UG01 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
IFT172Q9UG01 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
IFT172Q9UG01 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC31.64■■■□□ 2.66
IFT172Q9UG01 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
IFT172Q9UG01 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
IFT172Q9UG01 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
IFT172Q9UG01 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
IFT172Q9UG01 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
IFT172Q9UG01 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
IFT172Q9UG01 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
IFT172Q9UG01 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
IFT172Q9UG01 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
IFT172Q9UG01 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
IFT172Q9UG01 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
IFT172Q9UG01 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC31.61■■■□□ 2.65
IFT172Q9UG01 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
IFT172Q9UG01 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
IFT172Q9UG01 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
IFT172Q9UG01 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
IFT172Q9UG01 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
IFT172Q9UG01 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.61■■■□□ 2.65
IFT172Q9UG01 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC31.61■■■□□ 2.65
IFT172Q9UG01 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
IFT172Q9UG01 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
IFT172Q9UG01 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
IFT172Q9UG01 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
IFT172Q9UG01 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
IFT172Q9UG01 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
IFT172Q9UG01 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
IFT172Q9UG01 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
IFT172Q9UG01 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.59■■■□□ 2.65
IFT172Q9UG01 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
IFT172Q9UG01 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
IFT172Q9UG01 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
IFT172Q9UG01 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
IFT172Q9UG01 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
IFT172Q9UG01 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
IFT172Q9UG01 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
IFT172Q9UG01 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
IFT172Q9UG01 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
IFT172Q9UG01 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
IFT172Q9UG01 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
IFT172Q9UG01 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
IFT172Q9UG01 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC31.58■■■□□ 2.65
IFT172Q9UG01 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.65
IFT172Q9UG01 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
IFT172Q9UG01 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
IFT172Q9UG01 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
IFT172Q9UG01 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
IFT172Q9UG01 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
IFT172Q9UG01 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
IFT172Q9UG01 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC31.57■■■□□ 2.64
IFT172Q9UG01 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
IFT172Q9UG01 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC31.57■■■□□ 2.64
IFT172Q9UG01 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
IFT172Q9UG01 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
IFT172Q9UG01 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
IFT172Q9UG01 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
IFT172Q9UG01 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
IFT172Q9UG01 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC31.56■■■□□ 2.64
IFT172Q9UG01 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC31.56■■■□□ 2.64
IFT172Q9UG01 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
IFT172Q9UG01 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
IFT172Q9UG01 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
IFT172Q9UG01 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC31.55■■■□□ 2.64
IFT172Q9UG01 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC31.55■■■□□ 2.64
IFT172Q9UG01 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC31.55■■■□□ 2.64
IFT172Q9UG01 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
IFT172Q9UG01 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
IFT172Q9UG01 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC31.55■■■□□ 2.64
IFT172Q9UG01 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
IFT172Q9UG01 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
IFT172Q9UG01 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
IFT172Q9UG01 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
IFT172Q9UG01 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
IFT172Q9UG01 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC31.54■■■□□ 2.64
IFT172Q9UG01 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC31.54■■■□□ 2.64
IFT172Q9UG01 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
IFT172Q9UG01 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
IFT172Q9UG01 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
IFT172Q9UG01 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
IFT172Q9UG01 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
IFT172Q9UG01 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
IFT172Q9UG01 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms