Protein–RNA interactions for Protein: Q9UEE9

CFDP1, Craniofacial development protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFDP1Q9UEE9 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
CFDP1Q9UEE9 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
CFDP1Q9UEE9 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
CFDP1Q9UEE9 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
CFDP1Q9UEE9 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
CFDP1Q9UEE9 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
CFDP1Q9UEE9 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
CFDP1Q9UEE9 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
CFDP1Q9UEE9 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
CFDP1Q9UEE9 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
CFDP1Q9UEE9 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
CFDP1Q9UEE9 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
CFDP1Q9UEE9 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
CFDP1Q9UEE9 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
CFDP1Q9UEE9 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
CFDP1Q9UEE9 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC33.84■■■■□ 3.01
CFDP1Q9UEE9 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC33.84■■■■□ 3.01
CFDP1Q9UEE9 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
CFDP1Q9UEE9 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
CFDP1Q9UEE9 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
CFDP1Q9UEE9 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
CFDP1Q9UEE9 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
CFDP1Q9UEE9 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
CFDP1Q9UEE9 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
CFDP1Q9UEE9 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
CFDP1Q9UEE9 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC33.83■■■■□ 3.01
CFDP1Q9UEE9 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
CFDP1Q9UEE9 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
CFDP1Q9UEE9 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
CFDP1Q9UEE9 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
CFDP1Q9UEE9 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC33.82■■■■□ 3
CFDP1Q9UEE9 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC33.82■■■■□ 3
CFDP1Q9UEE9 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC33.82■■■■□ 3
CFDP1Q9UEE9 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
CFDP1Q9UEE9 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC33.82■■■■□ 3
CFDP1Q9UEE9 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
CFDP1Q9UEE9 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
CFDP1Q9UEE9 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
CFDP1Q9UEE9 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
CFDP1Q9UEE9 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC33.81■■■■□ 3
CFDP1Q9UEE9 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC33.81■■■■□ 3
CFDP1Q9UEE9 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
CFDP1Q9UEE9 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
CFDP1Q9UEE9 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
CFDP1Q9UEE9 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC33.81■■■■□ 3
CFDP1Q9UEE9 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
CFDP1Q9UEE9 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
CFDP1Q9UEE9 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
CFDP1Q9UEE9 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
CFDP1Q9UEE9 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
CFDP1Q9UEE9 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
CFDP1Q9UEE9 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
CFDP1Q9UEE9 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC33.79■■■■□ 3
CFDP1Q9UEE9 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.79■■■■□ 3
CFDP1Q9UEE9 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
CFDP1Q9UEE9 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
CFDP1Q9UEE9 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
CFDP1Q9UEE9 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC33.79■■■■□ 3
CFDP1Q9UEE9 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
CFDP1Q9UEE9 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC33.79■■■■□ 3
CFDP1Q9UEE9 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC33.79■■■■□ 3
CFDP1Q9UEE9 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
CFDP1Q9UEE9 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
CFDP1Q9UEE9 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.78■■■■□ 3
CFDP1Q9UEE9 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
CFDP1Q9UEE9 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC33.78■■■■□ 3
CFDP1Q9UEE9 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC33.78■■■■□ 3
CFDP1Q9UEE9 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
CFDP1Q9UEE9 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC33.78■■■■□ 3
CFDP1Q9UEE9 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
CFDP1Q9UEE9 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
CFDP1Q9UEE9 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
CFDP1Q9UEE9 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
CFDP1Q9UEE9 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
CFDP1Q9UEE9 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
CFDP1Q9UEE9 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
CFDP1Q9UEE9 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
CFDP1Q9UEE9 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
CFDP1Q9UEE9 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
CFDP1Q9UEE9 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
CFDP1Q9UEE9 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.76■■■□□ 2.99
CFDP1Q9UEE9 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC33.76■■■□□ 2.99
CFDP1Q9UEE9 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
CFDP1Q9UEE9 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
CFDP1Q9UEE9 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
CFDP1Q9UEE9 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
CFDP1Q9UEE9 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC33.75■■■□□ 2.99
CFDP1Q9UEE9 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
CFDP1Q9UEE9 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC33.75■■■□□ 2.99
CFDP1Q9UEE9 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
CFDP1Q9UEE9 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
CFDP1Q9UEE9 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
CFDP1Q9UEE9 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC33.75■■■□□ 2.99
CFDP1Q9UEE9 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
CFDP1Q9UEE9 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
CFDP1Q9UEE9 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
CFDP1Q9UEE9 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
CFDP1Q9UEE9 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
CFDP1Q9UEE9 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
CFDP1Q9UEE9 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.74■■■□□ 2.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms