Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDT6

CLIP2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,046 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP2Q9UDT6 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CLIP2Q9UDT6 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CLIP2Q9UDT6 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CLIP2Q9UDT6 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CLIP2Q9UDT6 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
CLIP2Q9UDT6 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
CLIP2Q9UDT6 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CLIP2Q9UDT6 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CLIP2Q9UDT6 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CLIP2Q9UDT6 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CLIP2Q9UDT6 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CLIP2Q9UDT6 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CLIP2Q9UDT6 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CLIP2Q9UDT6 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CLIP2Q9UDT6 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CLIP2Q9UDT6 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CLIP2Q9UDT6 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CLIP2Q9UDT6 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CLIP2Q9UDT6 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CLIP2Q9UDT6 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CLIP2Q9UDT6 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CLIP2Q9UDT6 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CLIP2Q9UDT6 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CLIP2Q9UDT6 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CLIP2Q9UDT6 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CLIP2Q9UDT6 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CLIP2Q9UDT6 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CLIP2Q9UDT6 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CLIP2Q9UDT6 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CLIP2Q9UDT6 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CLIP2Q9UDT6 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CLIP2Q9UDT6 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CLIP2Q9UDT6 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CLIP2Q9UDT6 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CLIP2Q9UDT6 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CLIP2Q9UDT6 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
CLIP2Q9UDT6 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CLIP2Q9UDT6 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CLIP2Q9UDT6 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CLIP2Q9UDT6 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CLIP2Q9UDT6 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CLIP2Q9UDT6 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CLIP2Q9UDT6 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CLIP2Q9UDT6 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CLIP2Q9UDT6 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CLIP2Q9UDT6 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CLIP2Q9UDT6 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CLIP2Q9UDT6 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CLIP2Q9UDT6 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CLIP2Q9UDT6 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CLIP2Q9UDT6 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CLIP2Q9UDT6 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CLIP2Q9UDT6 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
CLIP2Q9UDT6 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CLIP2Q9UDT6 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
CLIP2Q9UDT6 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CLIP2Q9UDT6 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CLIP2Q9UDT6 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CLIP2Q9UDT6 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CLIP2Q9UDT6 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CLIP2Q9UDT6 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CLIP2Q9UDT6 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CLIP2Q9UDT6 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CLIP2Q9UDT6 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CLIP2Q9UDT6 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CLIP2Q9UDT6 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CLIP2Q9UDT6 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CLIP2Q9UDT6 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CLIP2Q9UDT6 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CLIP2Q9UDT6 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CLIP2Q9UDT6 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CLIP2Q9UDT6 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CLIP2Q9UDT6 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CLIP2Q9UDT6 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CLIP2Q9UDT6 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CLIP2Q9UDT6 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CLIP2Q9UDT6 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CLIP2Q9UDT6 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CLIP2Q9UDT6 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CLIP2Q9UDT6 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CLIP2Q9UDT6 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CLIP2Q9UDT6 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CLIP2Q9UDT6 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CLIP2Q9UDT6 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CLIP2Q9UDT6 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CLIP2Q9UDT6 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
CLIP2Q9UDT6 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CLIP2Q9UDT6 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CLIP2Q9UDT6 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CLIP2Q9UDT6 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CLIP2Q9UDT6 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CLIP2Q9UDT6 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CLIP2Q9UDT6 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CLIP2Q9UDT6 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CLIP2Q9UDT6 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CLIP2Q9UDT6 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
CLIP2Q9UDT6 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CLIP2Q9UDT6 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CLIP2Q9UDT6 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CLIP2Q9UDT6 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms