Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBY0

SLC9A2, Sodium/hydrogen exchanger 2, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A2Q9UBY0 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC9A2Q9UBY0 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC9A2Q9UBY0 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC9A2Q9UBY0 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC9A2Q9UBY0 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC9A2Q9UBY0 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC9A2Q9UBY0 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC9A2Q9UBY0 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC9A2Q9UBY0 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC9A2Q9UBY0 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC9A2Q9UBY0 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC9A2Q9UBY0 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC9A2Q9UBY0 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC9A2Q9UBY0 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC9A2Q9UBY0 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC9A2Q9UBY0 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC9A2Q9UBY0 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC9A2Q9UBY0 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC9A2Q9UBY0 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC9A2Q9UBY0 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC9A2Q9UBY0 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC9A2Q9UBY0 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC9A2Q9UBY0 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC9A2Q9UBY0 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC9A2Q9UBY0 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC9A2Q9UBY0 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC9A2Q9UBY0 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC9A2Q9UBY0 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC9A2Q9UBY0 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC9A2Q9UBY0 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC9A2Q9UBY0 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC9A2Q9UBY0 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC9A2Q9UBY0 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC9A2Q9UBY0 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC9A2Q9UBY0 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC9A2Q9UBY0 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC9A2Q9UBY0 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC9A2Q9UBY0 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC9A2Q9UBY0 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC9A2Q9UBY0 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC9A2Q9UBY0 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC9A2Q9UBY0 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC9A2Q9UBY0 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC9A2Q9UBY0 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC9A2Q9UBY0 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC9A2Q9UBY0 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC9A2Q9UBY0 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC9A2Q9UBY0 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC9A2Q9UBY0 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC9A2Q9UBY0 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC9A2Q9UBY0 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC9A2Q9UBY0 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC9A2Q9UBY0 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC9A2Q9UBY0 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC9A2Q9UBY0 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC9A2Q9UBY0 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC9A2Q9UBY0 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC9A2Q9UBY0 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC9A2Q9UBY0 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC9A2Q9UBY0 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC9A2Q9UBY0 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC9A2Q9UBY0 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC9A2Q9UBY0 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC9A2Q9UBY0 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC9A2Q9UBY0 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC9A2Q9UBY0 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SLC9A2Q9UBY0 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC9A2Q9UBY0 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC9A2Q9UBY0 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC9A2Q9UBY0 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC9A2Q9UBY0 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC9A2Q9UBY0 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC9A2Q9UBY0 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC9A2Q9UBY0 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC9A2Q9UBY0 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC9A2Q9UBY0 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC9A2Q9UBY0 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC9A2Q9UBY0 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC9A2Q9UBY0 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC9A2Q9UBY0 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC9A2Q9UBY0 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC9A2Q9UBY0 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC9A2Q9UBY0 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC9A2Q9UBY0 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC9A2Q9UBY0 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC9A2Q9UBY0 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC9A2Q9UBY0 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC9A2Q9UBY0 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC9A2Q9UBY0 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC9A2Q9UBY0 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC9A2Q9UBY0 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC9A2Q9UBY0 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC9A2Q9UBY0 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC9A2Q9UBY0 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC9A2Q9UBY0 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC9A2Q9UBY0 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC9A2Q9UBY0 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC9A2Q9UBY0 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC9A2Q9UBY0 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC9A2Q9UBY0 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms