Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBV8

PEF1, Peflin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEF1Q9UBV8 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PEF1Q9UBV8 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PEF1Q9UBV8 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PEF1Q9UBV8 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PEF1Q9UBV8 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PEF1Q9UBV8 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PEF1Q9UBV8 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PEF1Q9UBV8 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PEF1Q9UBV8 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PEF1Q9UBV8 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PEF1Q9UBV8 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PEF1Q9UBV8 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PEF1Q9UBV8 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PEF1Q9UBV8 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PEF1Q9UBV8 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PEF1Q9UBV8 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PEF1Q9UBV8 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PEF1Q9UBV8 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PEF1Q9UBV8 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PEF1Q9UBV8 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PEF1Q9UBV8 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PEF1Q9UBV8 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PEF1Q9UBV8 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PEF1Q9UBV8 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PEF1Q9UBV8 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PEF1Q9UBV8 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PEF1Q9UBV8 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PEF1Q9UBV8 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PEF1Q9UBV8 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PEF1Q9UBV8 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PEF1Q9UBV8 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PEF1Q9UBV8 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PEF1Q9UBV8 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PEF1Q9UBV8 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PEF1Q9UBV8 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PEF1Q9UBV8 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PEF1Q9UBV8 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PEF1Q9UBV8 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PEF1Q9UBV8 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PEF1Q9UBV8 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PEF1Q9UBV8 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PEF1Q9UBV8 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
PEF1Q9UBV8 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PEF1Q9UBV8 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PEF1Q9UBV8 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PEF1Q9UBV8 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PEF1Q9UBV8 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PEF1Q9UBV8 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PEF1Q9UBV8 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PEF1Q9UBV8 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PEF1Q9UBV8 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PEF1Q9UBV8 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PEF1Q9UBV8 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PEF1Q9UBV8 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PEF1Q9UBV8 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PEF1Q9UBV8 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PEF1Q9UBV8 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PEF1Q9UBV8 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PEF1Q9UBV8 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PEF1Q9UBV8 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PEF1Q9UBV8 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PEF1Q9UBV8 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PEF1Q9UBV8 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PEF1Q9UBV8 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PEF1Q9UBV8 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PEF1Q9UBV8 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PEF1Q9UBV8 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PEF1Q9UBV8 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PEF1Q9UBV8 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PEF1Q9UBV8 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PEF1Q9UBV8 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PEF1Q9UBV8 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PEF1Q9UBV8 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PEF1Q9UBV8 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PEF1Q9UBV8 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PEF1Q9UBV8 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PEF1Q9UBV8 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PEF1Q9UBV8 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PEF1Q9UBV8 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PEF1Q9UBV8 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PEF1Q9UBV8 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PEF1Q9UBV8 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PEF1Q9UBV8 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PEF1Q9UBV8 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PEF1Q9UBV8 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PEF1Q9UBV8 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PEF1Q9UBV8 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PEF1Q9UBV8 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PEF1Q9UBV8 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PEF1Q9UBV8 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PEF1Q9UBV8 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PEF1Q9UBV8 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PEF1Q9UBV8 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PEF1Q9UBV8 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PEF1Q9UBV8 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PEF1Q9UBV8 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PEF1Q9UBV8 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PEF1Q9UBV8 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PEF1Q9UBV8 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PEF1Q9UBV8 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms