Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN4

TRPC4, Short transient receptor potential channel 4, humanhuman

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC4Q9UBN4 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRPC4Q9UBN4 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRPC4Q9UBN4 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
TRPC4Q9UBN4 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRPC4Q9UBN4 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRPC4Q9UBN4 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
TRPC4Q9UBN4 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRPC4Q9UBN4 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRPC4Q9UBN4 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRPC4Q9UBN4 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRPC4Q9UBN4 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRPC4Q9UBN4 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRPC4Q9UBN4 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRPC4Q9UBN4 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRPC4Q9UBN4 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRPC4Q9UBN4 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRPC4Q9UBN4 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRPC4Q9UBN4 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRPC4Q9UBN4 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRPC4Q9UBN4 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
TRPC4Q9UBN4 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRPC4Q9UBN4 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
TRPC4Q9UBN4 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRPC4Q9UBN4 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRPC4Q9UBN4 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRPC4Q9UBN4 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRPC4Q9UBN4 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRPC4Q9UBN4 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRPC4Q9UBN4 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
TRPC4Q9UBN4 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRPC4Q9UBN4 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRPC4Q9UBN4 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRPC4Q9UBN4 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRPC4Q9UBN4 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRPC4Q9UBN4 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRPC4Q9UBN4 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRPC4Q9UBN4 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRPC4Q9UBN4 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRPC4Q9UBN4 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
TRPC4Q9UBN4 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRPC4Q9UBN4 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRPC4Q9UBN4 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRPC4Q9UBN4 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRPC4Q9UBN4 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRPC4Q9UBN4 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRPC4Q9UBN4 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
TRPC4Q9UBN4 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
TRPC4Q9UBN4 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRPC4Q9UBN4 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRPC4Q9UBN4 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRPC4Q9UBN4 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRPC4Q9UBN4 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
TRPC4Q9UBN4 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRPC4Q9UBN4 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRPC4Q9UBN4 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRPC4Q9UBN4 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRPC4Q9UBN4 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRPC4Q9UBN4 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRPC4Q9UBN4 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRPC4Q9UBN4 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRPC4Q9UBN4 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRPC4Q9UBN4 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRPC4Q9UBN4 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRPC4Q9UBN4 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRPC4Q9UBN4 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRPC4Q9UBN4 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRPC4Q9UBN4 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRPC4Q9UBN4 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRPC4Q9UBN4 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRPC4Q9UBN4 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRPC4Q9UBN4 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRPC4Q9UBN4 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRPC4Q9UBN4 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRPC4Q9UBN4 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRPC4Q9UBN4 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRPC4Q9UBN4 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRPC4Q9UBN4 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRPC4Q9UBN4 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRPC4Q9UBN4 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
TRPC4Q9UBN4 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRPC4Q9UBN4 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRPC4Q9UBN4 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
TRPC4Q9UBN4 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRPC4Q9UBN4 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRPC4Q9UBN4 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
TRPC4Q9UBN4 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TRPC4Q9UBN4 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
TRPC4Q9UBN4 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRPC4Q9UBN4 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRPC4Q9UBN4 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRPC4Q9UBN4 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRPC4Q9UBN4 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRPC4Q9UBN4 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
TRPC4Q9UBN4 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRPC4Q9UBN4 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRPC4Q9UBN4 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRPC4Q9UBN4 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRPC4Q9UBN4 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRPC4Q9UBN4 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRPC4Q9UBN4 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms