Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2W1

PSMC3IP, Homologous-pairing protein 2 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMC3IPQ9P2W1 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSMC3IPQ9P2W1 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSMC3IPQ9P2W1 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSMC3IPQ9P2W1 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSMC3IPQ9P2W1 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSMC3IPQ9P2W1 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSMC3IPQ9P2W1 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PSMC3IPQ9P2W1 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSMC3IPQ9P2W1 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSMC3IPQ9P2W1 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSMC3IPQ9P2W1 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSMC3IPQ9P2W1 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSMC3IPQ9P2W1 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
PSMC3IPQ9P2W1 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PSMC3IPQ9P2W1 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSMC3IPQ9P2W1 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSMC3IPQ9P2W1 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PSMC3IPQ9P2W1 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSMC3IPQ9P2W1 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSMC3IPQ9P2W1 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSMC3IPQ9P2W1 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSMC3IPQ9P2W1 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSMC3IPQ9P2W1 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSMC3IPQ9P2W1 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSMC3IPQ9P2W1 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSMC3IPQ9P2W1 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSMC3IPQ9P2W1 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSMC3IPQ9P2W1 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSMC3IPQ9P2W1 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSMC3IPQ9P2W1 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSMC3IPQ9P2W1 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSMC3IPQ9P2W1 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSMC3IPQ9P2W1 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSMC3IPQ9P2W1 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSMC3IPQ9P2W1 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSMC3IPQ9P2W1 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSMC3IPQ9P2W1 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSMC3IPQ9P2W1 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSMC3IPQ9P2W1 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSMC3IPQ9P2W1 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSMC3IPQ9P2W1 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSMC3IPQ9P2W1 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSMC3IPQ9P2W1 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSMC3IPQ9P2W1 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSMC3IPQ9P2W1 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSMC3IPQ9P2W1 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PSMC3IPQ9P2W1 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSMC3IPQ9P2W1 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSMC3IPQ9P2W1 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSMC3IPQ9P2W1 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSMC3IPQ9P2W1 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSMC3IPQ9P2W1 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PSMC3IPQ9P2W1 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PSMC3IPQ9P2W1 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSMC3IPQ9P2W1 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSMC3IPQ9P2W1 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSMC3IPQ9P2W1 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSMC3IPQ9P2W1 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSMC3IPQ9P2W1 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSMC3IPQ9P2W1 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSMC3IPQ9P2W1 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSMC3IPQ9P2W1 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PSMC3IPQ9P2W1 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSMC3IPQ9P2W1 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSMC3IPQ9P2W1 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSMC3IPQ9P2W1 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSMC3IPQ9P2W1 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSMC3IPQ9P2W1 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSMC3IPQ9P2W1 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSMC3IPQ9P2W1 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSMC3IPQ9P2W1 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PSMC3IPQ9P2W1 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSMC3IPQ9P2W1 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSMC3IPQ9P2W1 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSMC3IPQ9P2W1 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PSMC3IPQ9P2W1 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSMC3IPQ9P2W1 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PSMC3IPQ9P2W1 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSMC3IPQ9P2W1 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PSMC3IPQ9P2W1 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PSMC3IPQ9P2W1 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PSMC3IPQ9P2W1 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PSMC3IPQ9P2W1 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PSMC3IPQ9P2W1 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PSMC3IPQ9P2W1 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PSMC3IPQ9P2W1 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PSMC3IPQ9P2W1 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PSMC3IPQ9P2W1 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PSMC3IPQ9P2W1 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PSMC3IPQ9P2W1 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PSMC3IPQ9P2W1 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSMC3IPQ9P2W1 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSMC3IPQ9P2W1 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSMC3IPQ9P2W1 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSMC3IPQ9P2W1 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSMC3IPQ9P2W1 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PSMC3IPQ9P2W1 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSMC3IPQ9P2W1 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSMC3IPQ9P2W1 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PSMC3IPQ9P2W1 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms