Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K6

KLHL42, Kelch-like protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL42Q9P2K6 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KLHL42Q9P2K6 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
KLHL42Q9P2K6 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KLHL42Q9P2K6 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KLHL42Q9P2K6 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KLHL42Q9P2K6 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KLHL42Q9P2K6 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KLHL42Q9P2K6 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KLHL42Q9P2K6 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KLHL42Q9P2K6 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KLHL42Q9P2K6 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KLHL42Q9P2K6 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
KLHL42Q9P2K6 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KLHL42Q9P2K6 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KLHL42Q9P2K6 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KLHL42Q9P2K6 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KLHL42Q9P2K6 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KLHL42Q9P2K6 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KLHL42Q9P2K6 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KLHL42Q9P2K6 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLHL42Q9P2K6 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLHL42Q9P2K6 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLHL42Q9P2K6 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLHL42Q9P2K6 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLHL42Q9P2K6 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLHL42Q9P2K6 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLHL42Q9P2K6 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLHL42Q9P2K6 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLHL42Q9P2K6 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
KLHL42Q9P2K6 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
KLHL42Q9P2K6 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLHL42Q9P2K6 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLHL42Q9P2K6 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLHL42Q9P2K6 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLHL42Q9P2K6 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KLHL42Q9P2K6 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KLHL42Q9P2K6 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KLHL42Q9P2K6 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
KLHL42Q9P2K6 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KLHL42Q9P2K6 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KLHL42Q9P2K6 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
KLHL42Q9P2K6 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
KLHL42Q9P2K6 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KLHL42Q9P2K6 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KLHL42Q9P2K6 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KLHL42Q9P2K6 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KLHL42Q9P2K6 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KLHL42Q9P2K6 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KLHL42Q9P2K6 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KLHL42Q9P2K6 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KLHL42Q9P2K6 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KLHL42Q9P2K6 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KLHL42Q9P2K6 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KLHL42Q9P2K6 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
KLHL42Q9P2K6 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
KLHL42Q9P2K6 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
KLHL42Q9P2K6 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
KLHL42Q9P2K6 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KLHL42Q9P2K6 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KLHL42Q9P2K6 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KLHL42Q9P2K6 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KLHL42Q9P2K6 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KLHL42Q9P2K6 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KLHL42Q9P2K6 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KLHL42Q9P2K6 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
KLHL42Q9P2K6 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
KLHL42Q9P2K6 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
KLHL42Q9P2K6 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KLHL42Q9P2K6 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KLHL42Q9P2K6 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KLHL42Q9P2K6 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KLHL42Q9P2K6 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
KLHL42Q9P2K6 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
KLHL42Q9P2K6 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KLHL42Q9P2K6 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
KLHL42Q9P2K6 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KLHL42Q9P2K6 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
KLHL42Q9P2K6 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KLHL42Q9P2K6 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KLHL42Q9P2K6 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KLHL42Q9P2K6 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KLHL42Q9P2K6 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KLHL42Q9P2K6 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KLHL42Q9P2K6 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
KLHL42Q9P2K6 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KLHL42Q9P2K6 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KLHL42Q9P2K6 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KLHL42Q9P2K6 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KLHL42Q9P2K6 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KLHL42Q9P2K6 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KLHL42Q9P2K6 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KLHL42Q9P2K6 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KLHL42Q9P2K6 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KLHL42Q9P2K6 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KLHL42Q9P2K6 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KLHL42Q9P2K6 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KLHL42Q9P2K6 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KLHL42Q9P2K6 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KLHL42Q9P2K6 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KLHL42Q9P2K6 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms