Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J3

KLHL9, Kelch-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL9Q9P2J3 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KLHL9Q9P2J3 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
KLHL9Q9P2J3 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KLHL9Q9P2J3 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KLHL9Q9P2J3 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KLHL9Q9P2J3 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KLHL9Q9P2J3 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KLHL9Q9P2J3 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KLHL9Q9P2J3 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
KLHL9Q9P2J3 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
KLHL9Q9P2J3 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
KLHL9Q9P2J3 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KLHL9Q9P2J3 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KLHL9Q9P2J3 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KLHL9Q9P2J3 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
KLHL9Q9P2J3 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
KLHL9Q9P2J3 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
KLHL9Q9P2J3 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KLHL9Q9P2J3 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
KLHL9Q9P2J3 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
KLHL9Q9P2J3 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KLHL9Q9P2J3 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
KLHL9Q9P2J3 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KLHL9Q9P2J3 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
KLHL9Q9P2J3 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KLHL9Q9P2J3 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KLHL9Q9P2J3 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KLHL9Q9P2J3 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KLHL9Q9P2J3 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
KLHL9Q9P2J3 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
KLHL9Q9P2J3 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KLHL9Q9P2J3 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KLHL9Q9P2J3 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KLHL9Q9P2J3 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
KLHL9Q9P2J3 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
KLHL9Q9P2J3 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
KLHL9Q9P2J3 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
KLHL9Q9P2J3 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
KLHL9Q9P2J3 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
KLHL9Q9P2J3 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
KLHL9Q9P2J3 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
KLHL9Q9P2J3 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KLHL9Q9P2J3 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KLHL9Q9P2J3 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLHL9Q9P2J3 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLHL9Q9P2J3 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLHL9Q9P2J3 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLHL9Q9P2J3 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLHL9Q9P2J3 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLHL9Q9P2J3 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLHL9Q9P2J3 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLHL9Q9P2J3 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLHL9Q9P2J3 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLHL9Q9P2J3 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLHL9Q9P2J3 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLHL9Q9P2J3 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLHL9Q9P2J3 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLHL9Q9P2J3 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLHL9Q9P2J3 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLHL9Q9P2J3 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
KLHL9Q9P2J3 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
KLHL9Q9P2J3 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
KLHL9Q9P2J3 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
KLHL9Q9P2J3 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
KLHL9Q9P2J3 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
KLHL9Q9P2J3 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
KLHL9Q9P2J3 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
KLHL9Q9P2J3 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
KLHL9Q9P2J3 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
KLHL9Q9P2J3 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
KLHL9Q9P2J3 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
KLHL9Q9P2J3 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
KLHL9Q9P2J3 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
KLHL9Q9P2J3 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
KLHL9Q9P2J3 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
KLHL9Q9P2J3 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
KLHL9Q9P2J3 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
KLHL9Q9P2J3 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
KLHL9Q9P2J3 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
KLHL9Q9P2J3 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
KLHL9Q9P2J3 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
KLHL9Q9P2J3 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
KLHL9Q9P2J3 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
KLHL9Q9P2J3 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
KLHL9Q9P2J3 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
KLHL9Q9P2J3 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
KLHL9Q9P2J3 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
KLHL9Q9P2J3 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
KLHL9Q9P2J3 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
KLHL9Q9P2J3 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
KLHL9Q9P2J3 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
KLHL9Q9P2J3 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
KLHL9Q9P2J3 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
KLHL9Q9P2J3 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
KLHL9Q9P2J3 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
KLHL9Q9P2J3 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
KLHL9Q9P2J3 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
KLHL9Q9P2J3 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
KLHL9Q9P2J3 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
KLHL9Q9P2J3 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms