Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

Predictions only

Length 1,018 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
USP35Q9P2H5 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
USP35Q9P2H5 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
USP35Q9P2H5 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
USP35Q9P2H5 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
USP35Q9P2H5 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
USP35Q9P2H5 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
USP35Q9P2H5 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC29.83■■■□□ 2.37
USP35Q9P2H5 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
USP35Q9P2H5 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
USP35Q9P2H5 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
USP35Q9P2H5 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
USP35Q9P2H5 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
USP35Q9P2H5 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
USP35Q9P2H5 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
USP35Q9P2H5 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
USP35Q9P2H5 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
USP35Q9P2H5 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
USP35Q9P2H5 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.37
USP35Q9P2H5 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
USP35Q9P2H5 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
USP35Q9P2H5 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
USP35Q9P2H5 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
USP35Q9P2H5 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
USP35Q9P2H5 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
USP35Q9P2H5 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
USP35Q9P2H5 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
USP35Q9P2H5 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
USP35Q9P2H5 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
USP35Q9P2H5 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
USP35Q9P2H5 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
USP35Q9P2H5 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
USP35Q9P2H5 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
USP35Q9P2H5 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
USP35Q9P2H5 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
USP35Q9P2H5 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
USP35Q9P2H5 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
USP35Q9P2H5 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
USP35Q9P2H5 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
USP35Q9P2H5 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
USP35Q9P2H5 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
USP35Q9P2H5 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
USP35Q9P2H5 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
USP35Q9P2H5 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
USP35Q9P2H5 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
USP35Q9P2H5 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
USP35Q9P2H5 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
USP35Q9P2H5 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC29.79■■■□□ 2.36
USP35Q9P2H5 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
USP35Q9P2H5 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
USP35Q9P2H5 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
USP35Q9P2H5 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
USP35Q9P2H5 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC29.79■■■□□ 2.36
USP35Q9P2H5 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
USP35Q9P2H5 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
USP35Q9P2H5 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
USP35Q9P2H5 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
USP35Q9P2H5 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
USP35Q9P2H5 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC29.78■■■□□ 2.36
USP35Q9P2H5 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
USP35Q9P2H5 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
USP35Q9P2H5 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
USP35Q9P2H5 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
USP35Q9P2H5 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
USP35Q9P2H5 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
USP35Q9P2H5 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
USP35Q9P2H5 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
USP35Q9P2H5 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
USP35Q9P2H5 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
USP35Q9P2H5 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
USP35Q9P2H5 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
USP35Q9P2H5 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
USP35Q9P2H5 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
USP35Q9P2H5 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
USP35Q9P2H5 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
USP35Q9P2H5 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
USP35Q9P2H5 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
USP35Q9P2H5 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
USP35Q9P2H5 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC29.76■■■□□ 2.35
USP35Q9P2H5 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
USP35Q9P2H5 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
USP35Q9P2H5 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
USP35Q9P2H5 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
USP35Q9P2H5 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
USP35Q9P2H5 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
USP35Q9P2H5 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
USP35Q9P2H5 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
USP35Q9P2H5 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
USP35Q9P2H5 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
USP35Q9P2H5 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
USP35Q9P2H5 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
USP35Q9P2H5 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
USP35Q9P2H5 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
USP35Q9P2H5 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
USP35Q9P2H5 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
USP35Q9P2H5 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
USP35Q9P2H5 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
USP35Q9P2H5 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
USP35Q9P2H5 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
USP35Q9P2H5 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms