Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z3

HCN3, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, humanhuman

Predictions only

Length 774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN3Q9P1Z3 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
HCN3Q9P1Z3 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
HCN3Q9P1Z3 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HCN3Q9P1Z3 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
HCN3Q9P1Z3 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
HCN3Q9P1Z3 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HCN3Q9P1Z3 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HCN3Q9P1Z3 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HCN3Q9P1Z3 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HCN3Q9P1Z3 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
HCN3Q9P1Z3 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HCN3Q9P1Z3 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HCN3Q9P1Z3 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HCN3Q9P1Z3 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HCN3Q9P1Z3 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HCN3Q9P1Z3 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HCN3Q9P1Z3 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HCN3Q9P1Z3 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HCN3Q9P1Z3 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HCN3Q9P1Z3 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HCN3Q9P1Z3 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HCN3Q9P1Z3 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HCN3Q9P1Z3 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HCN3Q9P1Z3 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HCN3Q9P1Z3 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HCN3Q9P1Z3 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HCN3Q9P1Z3 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HCN3Q9P1Z3 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HCN3Q9P1Z3 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HCN3Q9P1Z3 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HCN3Q9P1Z3 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HCN3Q9P1Z3 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HCN3Q9P1Z3 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HCN3Q9P1Z3 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HCN3Q9P1Z3 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HCN3Q9P1Z3 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HCN3Q9P1Z3 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HCN3Q9P1Z3 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HCN3Q9P1Z3 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
HCN3Q9P1Z3 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
HCN3Q9P1Z3 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
HCN3Q9P1Z3 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HCN3Q9P1Z3 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HCN3Q9P1Z3 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HCN3Q9P1Z3 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HCN3Q9P1Z3 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HCN3Q9P1Z3 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HCN3Q9P1Z3 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HCN3Q9P1Z3 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HCN3Q9P1Z3 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HCN3Q9P1Z3 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HCN3Q9P1Z3 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HCN3Q9P1Z3 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
HCN3Q9P1Z3 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
HCN3Q9P1Z3 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HCN3Q9P1Z3 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
HCN3Q9P1Z3 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HCN3Q9P1Z3 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
HCN3Q9P1Z3 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HCN3Q9P1Z3 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HCN3Q9P1Z3 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HCN3Q9P1Z3 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
HCN3Q9P1Z3 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
HCN3Q9P1Z3 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HCN3Q9P1Z3 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HCN3Q9P1Z3 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
HCN3Q9P1Z3 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
HCN3Q9P1Z3 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HCN3Q9P1Z3 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HCN3Q9P1Z3 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HCN3Q9P1Z3 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HCN3Q9P1Z3 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HCN3Q9P1Z3 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
HCN3Q9P1Z3 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
HCN3Q9P1Z3 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
HCN3Q9P1Z3 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
HCN3Q9P1Z3 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
HCN3Q9P1Z3 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
HCN3Q9P1Z3 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
HCN3Q9P1Z3 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
HCN3Q9P1Z3 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
HCN3Q9P1Z3 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
HCN3Q9P1Z3 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
HCN3Q9P1Z3 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
HCN3Q9P1Z3 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
HCN3Q9P1Z3 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
HCN3Q9P1Z3 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HCN3Q9P1Z3 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HCN3Q9P1Z3 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HCN3Q9P1Z3 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HCN3Q9P1Z3 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
HCN3Q9P1Z3 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
HCN3Q9P1Z3 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HCN3Q9P1Z3 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HCN3Q9P1Z3 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HCN3Q9P1Z3 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HCN3Q9P1Z3 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HCN3Q9P1Z3 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HCN3Q9P1Z3 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HCN3Q9P1Z3 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms