Protein–RNA interactions for Protein: Q9P031

CCDC59, Thyroid transcription factor 1-associated protein 26, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC59Q9P031 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC59Q9P031 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC59Q9P031 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC59Q9P031 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC59Q9P031 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC59Q9P031 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC59Q9P031 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC59Q9P031 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC59Q9P031 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC59Q9P031 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC59Q9P031 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC59Q9P031 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC59Q9P031 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC59Q9P031 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC59Q9P031 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC59Q9P031 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC59Q9P031 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC59Q9P031 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC59Q9P031 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC59Q9P031 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC59Q9P031 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC59Q9P031 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC59Q9P031 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC59Q9P031 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC59Q9P031 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC59Q9P031 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC59Q9P031 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC59Q9P031 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC59Q9P031 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC59Q9P031 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC59Q9P031 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC59Q9P031 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC59Q9P031 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC59Q9P031 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC59Q9P031 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC59Q9P031 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC59Q9P031 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC59Q9P031 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC59Q9P031 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC59Q9P031 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC59Q9P031 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC59Q9P031 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC59Q9P031 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC59Q9P031 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC59Q9P031 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC59Q9P031 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC59Q9P031 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC59Q9P031 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC59Q9P031 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC59Q9P031 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC59Q9P031 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC59Q9P031 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC59Q9P031 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC59Q9P031 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC59Q9P031 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC59Q9P031 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC59Q9P031 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC59Q9P031 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC59Q9P031 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC59Q9P031 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC59Q9P031 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC59Q9P031 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC59Q9P031 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC59Q9P031 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC59Q9P031 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC59Q9P031 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC59Q9P031 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC59Q9P031 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC59Q9P031 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC59Q9P031 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC59Q9P031 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC59Q9P031 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC59Q9P031 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC59Q9P031 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC59Q9P031 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC59Q9P031 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC59Q9P031 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC59Q9P031 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC59Q9P031 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC59Q9P031 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC59Q9P031 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC59Q9P031 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC59Q9P031 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC59Q9P031 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC59Q9P031 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC59Q9P031 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC59Q9P031 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC59Q9P031 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC59Q9P031 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC59Q9P031 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC59Q9P031 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC59Q9P031 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC59Q9P031 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC59Q9P031 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC59Q9P031 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC59Q9P031 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC59Q9P031 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC59Q9P031 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC59Q9P031 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC59Q9P031 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms